四川镇守太监罗龠请便宜行事，瑾实主之。由是各处镇守，皆比例奏要，如巡抚都御史之任，干预刑名诸政。刘瑾捏旨批出，皆许便宜而行。河南太监廖堂亦奏兼管修河，剥取民财，遍于乡野，辇送数千余万于京师。太监毕真初差天津取海鲜，敛财数万，请换敕，起自天津历山东沿海，达于苏、松、福建。所至括取民财，凌辱官吏，莫敢声言。先朝故事：奏准，六部差官则该部请敕，必具事由送内阁写敕，未有不由六部，而内阁自出敕者也。毕真辈之敕并近日内官赐祠额护敕，皆瑾与内阁李、焦辈创为之。时李公为首相，若肯执奏请敕必由六部具由，此祖宗故事，我辈不敢违，况《大明律》有结党乱政之法甚重。如此，纵使不从，亦不过如刘、谢等去位而已。乃不能然，谁之过欤？
边方召商贾纳粮草情弊，瑾素知其故。一日，因户部奏差给事中三年一次查盘，奏内有“粮粗秕，草浥烂”者，瑾遂票旨逮系各年巡抚都御史、管粮郎中数人下狱。既而锁杻差人押至所任地方，加倍赔偿。又商人纳过粮草，拖欠价银，亦皆没官不给。由是商贾重困，边储渐乏。
刘瑾因户部奏送各边年例银两，瑾以为先朝无此例，令户部查天顺以前年例银数。顾尚书佐以天顺年前无银例回报。瑾大怒曰：“此户部官通同边方巡抚都御史共盗内帑银两之明验也。”悉追问致罪，革罢送银之例，边储至是缺甚。盖自成化八年间设榆林镇，巡抚余都御史子俊增置城寨，陕西民供馈不继，奏送江南折粮银，以补不足。然初亦依江南原折银例，每米一石，折银二钱五分放支军士。其后大同等边缺乏，亦暂送银补足，数皆不多，未有以万计送者。弘治间户部叶尚书淇，淮安人，盐商皆淇亲识，因与淇议：“商人赴边纳银，价少而有远涉之虞；在运司纳银，价多而得易办之便。”时内阁徐溥与淇同年交好，遂从其议，奏准两淮运司盐课，于运司开中纳银解户部，送太仓银库收贮。分送各边盐价，积至一百余万，人为利便，而不知坏旧法也。盖洪武、永乐以来，天下盐课俱开中各边，上纳本色米豆，商人欲求盐利，预于近边转运本色，以待开盐报中，故边方粟豆无甚贵之时。今废商人赴边报中之法，虽曰得价多，而近边米豆无人买运，遂致腾涌。正德五年，侍郎丛兰整理陕西边储，遂令百姓每石征银二钱五分，准米一石。盖六部政本，少有差错，胎弊如此。使顾尚书当刘瑾查例之时，答曰：“昔盐课在各边上纳，故无年例银之送。后改盐课纳银解京，故不得不分送各边。”如此，瑾必不怒而反正盐法，淇其不免矣。
逆瑾以富国为名，每欲巧取横敛，且因以窘迫文臣。凡有公错诖误者，辄捏旨以姑免提问为名，各罚米粟以实边储。士大夫畏其凌虐，亦甘心从罚。初自一二百石，后渐增至千五百石。坐此破家者甚众。
自逆瑾用事，文臣裁抑至甚，内官、武弁纵横而行。瑾等数人，皆赠父祖为都督、都指挥，母为夫人，造坟祭葬。该部不敢执，科道不敢言。其诰命、祭文，皆内阁所撰。议者以当时内阁诸公，结党乱政之罪不可掩也。至文臣三品以上祭葬，却沮格不与。如侍郎郝志义故，其子援例乞祭葬，瑾以为洪武礼制，文臣无祭葬之例，皆后来文臣专权擅加。传旨，遂下锦衣卫狱，问发充军。学士武卫病故，其子乞恩，亦下狱。其弄权裁抑文臣如此。
初，《大明会典》成，内阁自李东阳而下至翰林、春坊皆升职。瑾以为破坏祖宗制书，妄增新例，毁其书，悉追夺各官升职，惟东阳不夺。瑾又欲挫抑文学官，乃捏旨谓翰林官不识事体，摘十余人姓名，升调两京各部属官，令其拓充政事。朝野哄然。
逆瑾又欲革天下巡抚官，云旧制所无，天顺间亦曾革罢，遂将各处巡抚都御史取回。后与内阁议不可，止将腹里巡抚革去，其漕运及边方都御史俱不革。又欲将各衙门添设官及提学、兵备悉行裁革，后内阁议提学不可革，从之。
华容刘尚书大夏既致仕，逆瑾知其受知先朝，常欲按致于法。又被同年焦芳忌嫉，会广西土官岑猛先年被大夏与都御史潘蕃奏迁福建，至是厚赂得复。瑾遂以迁徙土官为非法，通逮至京，欲寘刘等重辟。下之廷议，诸大臣不敢吐一语。独屠都御史滽曰：“刘大夏此何罪，必欲致之死？当拟‘不应’。”瑾怒骂屠恶语：“汝党刘邪？”明日大臣以屠议奏。瑾谋于焦芳并刘宇，宇又素嫉刘者，乃劾刘某轻将夷人迁徙，与潘蕃俱发边戍。瑾初拟广西边卫，焦曰：“是送二人归也。”乃定肃州卫。刘赴肃州时，故旧皆避不来会。独乡人严仲宏赠诗，和答之。《过六盘山寄李阁老》末句云：“寄谢同年老知己，天涯孤客几时还？”《归自六盘和前韵》末句云：“凭谁寄语中州子，前度刘郎今已还。”中州子指芳、宇二人也。