四十五年正月乙酉，九卿议奏：“高家堰三坝下及文华寺地方挑河、建闸、筑堤。又涧、河、清沟、虾沟挑河等工，约估银五十八万九百两零。保举八旗、部、院官共一百四十四员，俱令引见。江宁、镇江、杭州驻防官共四十九员，各拨副都统一员，协领二员，带往协同监工。其督工部、院堂官伏候简用，速往兴工。京城官员领户部库银，江宁等处官员各于本省藩库领银，每员派定三千两。计工均估，务照式样，节省修筑，若招摇生事、怠缓迟误，督工大臣及该督抚参奏，严加议处。有徇情隐庇，事发将原保大臣、督工大臣、总督、巡抚一并严加议处。其雇请人夫采买物料，派地方官一同料理，工完之日交总河防守。至溜淮套开河需银一百三十九万余两，约略估计甚属浮多，应交该督等核减具奏，另行请旨。”得旨：“依议。着孙渣齐、徐潮、铁图赫申、达尔华、蔡毓茂前往督工。”是月，免江南上元等二县上年水灾额赋有差。
二月丁巳，刑部议复：“江南、江西总督阿山参江宁府知府陈鹏年不将圣训供设吉地，大不敬。应将陈鹏年立斩。”得旨：“陈鹏年着革职，从宽免死，来京在修书处效力。”
五月丙寅，以张伯行为江苏按察使。
十月己酉，谕户部：“山西、陕西、甘肃、江苏、安徽、浙江、江西、湖北、湖南、福建、广东各省，自康熙四十三年以前未完地丁银二百一十二万二千七百两有奇，粮十万五千七百石有奇，着按数通行豁免。或旧欠已完在官而现年钱粮未完足者，亦准扣抵。谕旨到日，各该抚立行所属张示遍谕。如有不肖有司以完作欠、蒙混销算及开除不清者，该督抚即时奏参，严加治罪。”是月，免江南海州、淮安等十六州县卫水灾额赋有差。
十一月辛巳，以邵穆布为江南、江西总督。是月，免江南徐州水灾额赋有差。
四十六年正月丙子，上南巡启銮。
二月壬寅，上次清河，阅武家墩。癸卯，上阅视溜淮套，由清口登陆详看地方形势，驻跸曹家庙。甲辰，上自曹家庙还清口，将沿途所立开河标竿尽行撤去，百姓见之踊跃欢欣，咸曰：“圣上深仁厚德，不惟生者沾恩，亦且下及枯骨。我等无以报答，惟仰祝圣寿无疆而已。”丙午，谕江南、江西总督邵穆布、江苏巡抚于准等：“前总督阿山、总河张鹏翮、总漕桑额等奏称溜淮套地方开河，朕循行周览，断不可开。今溜淮套工已降旨停止，其湖水泛溢宜筹宣泄之道，故谕张鹏翮亲率能员于高家堰、蒋家坝相度旧有河形之处建闸蓄泄，以期永利。尔等可即张示遍谕各州县人等，咸悉朕慎重河务，周恤民隐之至意。”
庚戌，河道总督张鹏翮以误奏开溜淮套河具奏请罪。得旨：“黄、淮两河关系运道民生，总河身任河务必勿惮烦劳，时亲勘阅，将应修、应筑之处斟酌合宜，又能任用得人，斯为称职。张鹏翮听信小人徐光启议开溜淮套河，竟不能亲加审勘，辄奏称此河开浚有益，所立开河标竿至毁坏民间坟冢田庐。又地势甚高，虽开浚成河亦不能水出清口，徒滋生事扰民。张鹏翮轻举妄动，大负职掌。九卿、詹事、科道将张鹏翮并前会奏请开溜淮套督抚等，俱严加议处具奏。”
三月己未，上驻跸江宁。壬戌，上谒明太祖陵。己巳，上驻跸苏州。丙子，上驻跸松江。戊寅，上命地方官俱近前，训谕曰：“江南钱粮既多，火耗虽轻，断无不足养廉者。清乃居官之常，清官每多残酷，清而能宽斯为尽善。”己卯，以马逸姿为江苏按察使。
五月壬子朔，御舟泊山阳县，谕河道总督张鹏翮及河官：“古今治河形势不同，旧时常患清水不足敌黄水，每有黄水倒灌之虞。今清水敌黄水有余，运河清水甚大，反流入高邮湖。设高邮湖水涨溢入运河，则运河东堤受险，少有疏虞，虽堵塞不难，而生民田庐不可问矣，应加谨防护以保无虞。清口湖水七分敌黄，三分济运，今应将大墩分水处西岸草坝再加宽大，使清水多出黄河一分，少入运河一分，则运河东堤不至受险。又于蒋家坝开河建闸，引水由人字河、芒稻河下江，由下河及庙湾等处入海，不惟洪泽湖之水可以宣泄，而盱眙、泗州积水田地亦渐次涸出。水小则下板蓄水敌黄，水大则启板泄水，且便于商民舟楫往来。其祥符闸口门甚窄，趁此黄水不甚高之时，委干员将归仁、安仁、利仁三闸改宽泄水，则徐州一带民田可无淹没之虞矣。”丙子，九卿等议：“张鹏翮，阿山将溜淮套地势并不确视，以不可开浚者奏请开浚，殊为溺职，应将张鹏翮革职，阿山革任。桑额、刘光美、于准并不详确定议，各降五级调用。”上谕大学士等：“闻验视溜淮套之时，张鹏翮、桑额俱以为不可开，而阿山独强以为可开，公同奏请。着将阿山革任，张鹏翮革去所加官保，桑额降五级，刘光美、于准各降三级，俱从宽留任。”
十月辛巳，以江苏旱，发帑市米平粜。乙酉，谕户部：“江南自夏入秋，雨泽愆期，督抚先后奏至。朕念小民久未被灾，骤罹荒旱，所关甚巨，业经敕令停征并发仓谷赈济。顾仓储数少未足支给，惟各州、县截留漕米可以实惠及民。目下时已届冬，总漕桑额无事，着会同总督邵穆布、巡抚于准亲历被灾地方备加察勘，将今年所征漕粮，每州县或留八、九万石，或留十万石，酌量赈济之数，分别多寡，存留支散。及今漕米尚未开兑，截现收之粮，以济待哺之众，于民生大有裨益。其康熙四十三年以前，江苏巡抚所属未完民欠漕项银两六十八万七千两有奇、米麦三十一万一千八百石有奇，悉予豁免。用纾闾阎之余力，俾办额运之正供，事切利民，蠲逾常格，务使均沾实惠，以称朕深轸民依之意。”
十一月己酉朔，谕户部：蠲免其今年被灾安徽所属七州县、三卫，江苏所属二十五州县、三卫应征之康熙四十七年田亩银共二百九十七万五千二百余两，粮三十九万二千余石。是月，免江南太仓等州县被灾额赋有差。
十二月丁亥，督修上下两河、户部尚书徐潮等奏：“臣遵旨将蒋家坝至高邮湖等处工程，皆分与京中派出修河官员修筑，次第告竣，会同河道总督张鹏翮验明，取具印领讫。”下部知之。
四十七年正月乙亥，诏留湖广、江西漕米四十万石于江宁、苏州、松江、常州、镇江、扬州平粜。
六月乙丑，以江苏久雨米贵，命发截存漕米平粜。敕江西、湖广毋遏粜。
七月庚辰，工部议准：江南、江西总督邵穆布等奏：臣等遵旨亲勘各属水道，如苏州府太仓州、常熟县为通江入海要道，建闸启闭，以资蓄泄、灌溉田畴。其刘河等旧闸亦损坏，理应修葺。常州府武进县，镇江府丹阳、丹徒两县共计闸六座，年久坍圮，俱当修葺。至苏、松、常、镇四府属各支河小港关系水利处率皆淤浅，宜逐一疏浚。共计修建闸座并挑浚河工需银一十七万八千九百余两。从之。
十月戊午，诏免江南明年地丁额赋并停征旧欠。
十一月癸未，以赵世显为河道总督。
十二月壬戌，赈苏、松、常、淮、徐等五府；免苏、松、常三府白粮耗米九万七千余石。
四十八年三月戊寅，允张鹏翮请，复留河标下兵丁五百八十三名。
七月辛卯，以噶礼为江南、江西总督。
九月，免江南高邮等十一州县水灾额赋有差。
十月甲寅，以焦映汉为江苏按察使。
十一月壬午，江南、江西总督噶礼奏：“江苏布政使宜思恭贪婪，请革职审拟。”得旨：“宜思恭着革职，此案着尚书张鹏翮、学士噶敏图前往会同总漕桑额严提究拟具奏。其江苏巡抚于准案内并有干连，将于准解任．江苏巡抚员缺紧要，着福建巡抚张伯行调补；江苏布政司事，着苏州府知府陈鹏年署理。”
四十九年正月戊子，江南、江西总督噶礼奏：“臣前因江苏布政使宜思恭贪婪，曾经奏参。今查江苏藩库钱粮，宜思恭任内共亏空四十六万一千两有零，应请审追。”得旨：“着差往审事尚书张鹏翮等一并严审究拟具奏。”
五月辛未，刑部等衙门议准：“奉差江南审事、户部尚书张鹏翮奏，原任江苏布政使宜思恭于兑收钱粮时，勒索加耗，又受各属馈送，应拟绞监候。巡抚于准同城居住，并不纠劾，拟革职。”从之。癸酉，刑都议复：“奉差江南审事、户部尚书张鹏翮奏，宜思恭任江苏布政使时，因地方有赈济、平粜等事，与巡抚于准商议先将司库银垫用，俟扣各属每年停工等银还库。今补还二十九万七千余两，尚欠一十六万四千余两，并无可以扣抵之项，请在宜思恭、于准名下，勒限严追补完。”从之。癸未，以金世扬为江苏布政使。
六月戊午，先是江南、江西总督噶礼奏：“康熙四十六年间，荷蒙皇上颁发帑金，令江南督抚于苏州、松江、常州、镇江等处建闸开河。应用钱粮，苏州府知府陈鹏年于司库支银转发。苏松粮道贾朴于督修时先扣留三万四千余两，于完工详司报销止称余剩银二千四百余两，显系侵蚀。其承修各官办事草率，甚属溺职，相应一并奏参。”上命差往江南审事尚书张鹏翮等一并严审具奏。至是张鹏翻等复奏：“粮道贾朴督修河闸，倡议扣留钱粮为将来保固之用，遂行捏造印册，蒙混报销。革职布政使宜思恭，革职巡抚于准不详察具奏，除宜思恭已于别案拟罪外，贾朴、于准均应按律杖流，仍勒限追完。承修官、苏州府同知张廷采等，未照原估之处修治是实，均应革职，勒限补修。知府陈鹏年所发所存银两皆由巡抚饬令遵行，应无庸议。”得旨：“观张鹏翮所审建闸一案，各官皆议处，独陈鹏年脱然事外。陈鹏年本系重罪之人，朕从宽免其死罪，复授为知府，理应激切图报。乃身在同城，目见伊等侵扣，不尽力劝止，且此项钱粮出纳俱经陈鹏年之手，而任凭贾朴、于准指使，其公同作弊可知矣。今若免议，众心不服。大凡公事，虽系师生、同年、朋友亦当从公审理。张鹏翮所审此案内有畏惧、徇庇之处，着交与九卿严察议处。其同审理此案之学士噶敏图及总督噶礼、总漕桑额，着一并议处具奏。”