七月，成功以洪旭、陈煇督水师诸镇防守金、厦。自领大队舟师北上。初十日，至兴化黄石，令甘煇驻劄涵江，征催粮米。十三日，出屯狼崎，坐快哨巡视，闽安令黄霆把守。霆曰：闽安迫近内地，恐一旦有虞，援之不及，诸军危矣。成功曰：尔且暂守，当着人代汝。功回狼崎，拨护卫前镇陈斌、神器镇卢谦、右提督右镇余程等守闽安罗星塔，代黄霆从征。
八月十二日，成功至海门登岸逼攻黄岩县。守将王戎率兵与战，战败议降。知县刘登龙（辽东人，监生）劝戎坚守，戎执献成功。功嘉其节，令人说之，不从。乘守者睡，投江而死。功怜之，葬其尸于江滨。十八日，进围台州。马信单骑招降。总兵李泌同知府齐维蕃、临海知县黎岳詹献城降。
九月，天台、太平诸邑降，海门卫坚拒不纳。功遣万礼攻之，不得下。功亲到察阅地势，见城坚险，遂按兵，令监督宗继宁入城劝谕。守将张捷从继宁出见成功，功优待之。乞禁骚扰。前所刘崇闻捷献城，亦遣人投降。
永春县林永伪称起义勤王，聚众数万余，陷永春县。总督李率泰征各标兵将平之，乘胜议攻闽安。密遣标下投诚总兵张蕴玉、随征副将刘陞耀带兵三千，驾船潜渡长乐港，过罗星塔，截其归路，方进兵合攻。贼将余程战死，闽安复失（蕴玉，字云路，湖广武冈州人。业儒，有澄清志。时流寇猖横，率众卫乡，奋勇截杀，寇戒莫犯。后隶安国公刘承胤麾下，屡有战功，授总兵官。投诚，随征福建。性极聪明，凡经水程，便记忆礁线浅深。后平金门、铜山之功，官至粤东澳门副总兵）。
陈斌等死守罗星塔待援，总兵施琅遣人招斌。斌率卢谦等薙发投诚全师至福州。泰令大厅按册内花名领赏，五人一队，从东辕门入，由西辕门出，即收其器械，枭首千有余人。斩讫，方收斌与谦等，并杀之。但时呼传甚急，有出玩赌博、患病者，倩人代之，尚活有数十余颗。成功接陈斌请援文，恐闽安有失，两岛难保，遂弃台州南下。至狼崎，报斌已投诚，随拨陈尧策守狼崎，御闽安水师。功回厦门。
杨廷世、刘九皋齎表至粤西。时值起冷孟为兵部左侍郎（孟后为贵州巡抚。永历十二年四月，备御安隆，马进忠引兵入贵阳，冯收礼弃平越，大兵云至，孟为叛兵所执献功，谕薙发，骂不绝口而死），王应龙为司空。永历忽接成功本称：欲躬督舟师从瓜州、镇江而入，直取金陵。请命李定国、孙可望等领兵，由楚泛洞庭，会合恢复，以迎圣驾。永历随宣杨廷世、刘九皋入见。问成功兵船钱粮。二人对以舳舻千艘，战将数百员，雄兵二十余万。粮饷虽就地设取，尚有吕宋、日本、暹罗、咬口留吧、东京、咬趾等国洋船可以充继。永历大喜，下廷臣会议。冷孟奏曰：成功执大义，不肯从父投诚；远隔海滨，岁岁贡问不绝。今有大志，欲亲统舟师入镇江，直取金陵，与陛下恢复中兴，实有桓文尊周之义。宜加封晋秩，以鼓豪杰响应之心。永历又问：成功部下，所隶何爵？皋奏曰：悉系先朝侯伯。永历又问：尚有宗亲否？皋曰：有监国鲁王、宁靖王、泸溪王、巴东王、益王世子、周世孙……宗戚甚多。永历又问：待诸宗亲、侯、伯之礼如何？皋曰：凡诸王宗亲，成功以先帝所封宗人府府正之礼相见，月送俸禄。诸难臣逃归者，悉以先辈敬之。或授以参军，预谋军政。其侯伯来归者，有兵者，听其提调。执法无私，待人不贰，不让唐之汾阳也。
永历顾冷孟曰：所属部伍，尚有侯伯，卿当酌议加封何衔？曰：太祖祖训，外臣无封王例，故徐达以死后追赠王爵。今在扰攘之际，理应从权，不可徒守以经。如李定国不过以战胜定南王孔有德之功，遂封西宁王爵。成功系先帝赐姓，其与祖制无违，亦应封王，以便统众而收人心。永历曰：卿所奏甚合时宜，当议王号。孟曰：当以廷平一府封之。俟江南有功日，再进封一字亲王，方见次第。永历依议，着礼部铸延平王印，并册一道。另着杨廷世、刘九皋举成功部下将官有功者奏闻，以便加爵。廷世即举左提督王秀奇、右提督马信、中提督甘煇、前提督黄廷、后提督万礼、五军都督陈煇、兵官洪旭、户官郑泰等；永历遂封王秀奇为祥符伯、马信为建威伯、甘煇为崇明伯、黄廷为永安伯、万礼为建安伯、陈煇为忠靖伯、洪旭为忠振伯、郑泰加少傅；其余侯伯印数十颗，以锡有功。另以六部郎中各一员，随师纪录。赐上方剑，便宜行事。又自书手诏，令其速进师江南，伸大义于天下；号召英雄，勤王迎驾。遗漳平伯周金汤、太监刘国柱齎印册，同杨廷世、刘九皋从广西间道，由粤东龙门航海来厦。
十月二十八日，成功统舟师南下。十一月朔日，到南澳。忠勇侯陈霸曰：欲攻惠、潮，须防苏利、许龙。不如先取鸥汀，此寨粮足，当先取之。左戎旗林胜愿为先锋，功允之。令黄廷为帅，又分拨诸镇入揭阳、潮阳、澄海，以分其势；功遂回厦门。时值冬旱，壕寨悉干。廷令造木牌遮身，以铁锹掘寨脚，堆积火药地雷。火发，寨崩十有余丈。林胜督众乘势冲入；因恨其屡次率船截劫，屠戮殆尽，活者仅存百有余人而已。
十二月，周金汤、刘国柱、杨廷世、刘九皋等到厦门。成功率甘煇等诸文武，恭迎海埏，拜受延平王册封。请安毕，厚待周金汤、刘国柱，详询粤东进取情形。金汤曰：恢复在于人心。苟人人如贵藩之心，则中兴指日可俟。奈诸将各心其心耳！功是之。遂拜谢表，并会师江南疏，差参军徐孚远、太监刘之清、刘九皋同周金汤、刘国柱航海龙门复命。功设长史、审理、典宝、典杖、典仪、典膳等官，悉照王府行事。
顺治十五年戊戌（附永历十二年）正月，成功调南北征各提镇舟师回厦。
二月，挑选各提督壮勇者为亲军，厦门港筑演武亭操演。各以五百筋石力能举起遍游教场者五千人，画样与工官冯澄世，监造坚厚铁盔、铁铠及两臂、裙围、铁鞋等项，箭穿不入者。又制铁面，只露眼耳口鼻，妆画五彩如鬼形，手执斩马大力。每人以二兵各执器械副之，专砍马脚，临阵有进无退，名曰铁人。每人月给饷银三两。有功者，擢为营将。令左虎卫陈魁统之。
三月，遣右虎卫陈鹏统兵船南下攻许龙。龙率舟师出御，失利。鹏掠其边民而回。
四月，擢杨来嘉为亲丁镇，属前提督永安伯黄廷统辖，同忠振伯洪旭共商机务，守金、厦。擢思明州知州邓会为监督粮饷。又以薛联桂为思明州知州。修表遣杨廷世往粤西，报出师日期。独甘煇心中犹豫：以其恰封崇明伯，今欲往江南，必由崇明县地方经过，则前日活阎罗所示官至崇明，寿至崇明之句，不亦有验乎？因复请于成功曰：煇闻瓜镇限以铁链，此则船之艰于前进；两埏炮台密布，此则陆之难于登岸。况江南地方辽阔，以煇愚意，未可深入。不如俟李定国、孙可望二人会师信到，然后进兵，庶首尾相应，战守有方，可以一鼓见效。功曰：会师之举，不过欲牵制其势耳。岂不会师，而即不进兵者乎？况兵马云集，日费万金，岂可稽延，自老其师哉？遂大整兵船：以中提督崇明伯甘煇为前部先锋，统左虎卫陈魁铁人五千、护卫兵一万，并宣毅前镇陈泽、宣毅后镇吴豪、前冲镇刘巧、右虎镇陈鹏、后劲镇杨正、左冲镇郭义、后冲镇刘进忠、水武镇林世用等兵一万，配坐大熕船二十只、鸟船二十只、快哨十只，为首程；又遣右提督建威伯马信，统右先锋镇杨祖、援剿左镇林明、殿后镇黄昌、亲兵镇黄应、智武镇蓝衍、木武镇黄昭、正兵镇杨世德、火武镇魏标等兵二万，配坐大战船三十只、赶缯船二十只、快哨十只，为二程接应；又令后提督建安伯万礼，统援剿右镇贺世明、右冲镇蔡禄、宣毅中镇李化龙、神器镇杨祥、援剿中镇蔡文、宣毅左镇黄安、宣毅右镇巴臣兴、奇兵镇张魁等领兵二万，配坐大熕船三十只、船艍二十只、快哨十只，为第三程接应。成功自领侍卫陈尧策、五军都督张英、左武卫林胜、右武卫周全斌、吏官潘庚钟、户官林俞卿、礼官黄开泰、行营刑官程应璠、兵官张煌言、工官冯澄世、闽安侯周瑞、辅明侯林察、定西侯张名振、平北侯周鹤芝、忠定伯林习山、亲兵镇杨好、中权镇李泌、祥符伯五军戎政王秀奇、援剿前镇戴捷、援剿后镇刘猷、护卫右镇杨衍、参军林奇昌、纪许国、蔡鸣雷、监纪柯平等，配坐水师前镇阮美、一镇洪善、二镇蔡福、三镇林德、四镇毛玉、五镇陈瑞等船共一百二十只、兵四万，为合后。号称舟师一十万众，航船北上。
六月初七日，率众登岸犯平阳，守将单任暹降。十三日，瑞安县守将艾诚祥亦献城降。宣毅右镇兼管铁骑巴臣兴病故，功以黑祥云统其众。十六日，成功至温州，镇将坚守。功细度其城险固，惟征木料、粮饷出往舟山。
七月初二日，成功问引港官李顺：此去羊山多少水路？顺曰：西南风一日便到。其山皆羊，故名之。山上有大王庙，极灵显。海中有独眼龙，系孙真人医治，嘱其养性，勿得动气。故凡过往船只，暗献纸钱，暗着更鼓，不敢放炮鸣锣。若惊起发性，兴波鼓浪，船只难当。成功曰：此乃里巷之言。本藩尚欲驰驱天下，百神宾服，奚畏此一孽龙乎？不听，遂传令开船。初九日午时，到羊山，而各提镇咸至。随放炮鸣金，金鼓响天。不移时，风声徐起，浪叠千层，暂尔淜泙。忽而波涌翻江之势，搅海欲狂，船难收，互相触坏，弃碇破桅，遭浪遇礁，呼救遍海，不可胜计。护卫都督陈德、太监张忠跪请成功拜祝。功笑曰：此不过风时偶然耳，岂真有龙之发性耶？不听。奈风愈狂，电愈烁。忠等再求：跪恳藩主祷求！再无不息。成功方允冠带礼祝曰：成功统率三军，恢复中原。果天命有在，登时将诸船沈灭。如中兴有日，祈即浪恬风静。甫祷毕，随即天色晴明，江山如旧。功失四子睿、七子裕、八子温暨兵士数千人。其所存之船，亦各损坏，乃收回舟山修葺。诸提督咸劝功暂回厦门，功以业已出师，理无再还。
九月，修葺诸船报竣。成功督舟师至象山。初十日，知县徐福率父老出降，功安民毕。时各镇兵士逃者甚众，悉系北上新附。且讹言北将尽欲投诚，故援剿右镇贺世明船桅妆以粉色红色为号。功亦疑世明船桅之异，遂令姚国泰替世明统其众。又遣张英谕林世用、魏标、李泌、张魁，悉解兵权，为监督。世用大愤，不日死。擢总理监营翁天佑署左提督事。