十一日（壬辰），谕〔议政王军机大臣等〕：庆端奏（大股逆匪窜扑温郡瑞安，迫近闽疆）、徐宗干奏（温属军情吃紧）各一摺，浙江青田等处逆匪由瓯江过渡，窜扑温郡；复纠集台、衢各路逆党分路抄袭，并图扰瑞安、平阳二县，温州、瑞安均已被围。游击李朝安续募台勇到省，业经徐宗干派赴福宁，相机前进；并催令副将吴鸿源督全帮师船，由瑞、平驶赴温州策应。着庆端赶紧催提，以资战守；仍饬温州、瑞安城内文武固守待援，毋稍疏懈。曾玉明前经饬赴台湾，剿办彰化贼匪。兹据庆端奏：（赖得福阵亡，其部勇非曾玉明不能整集；即李朝安等之勇，亦须该员统率，方能得力）。着即饬带兵驰援温州，俟该郡情形稍松，再令赴台。洪毓琛於台湾地势民情均称熟悉，本日已降旨将该员调补台湾道；徐宗干即责成该道实力剿办。曾玉明既未能赴台，应如何添兵策应？并着妥筹办理。福宁距省不远，设有疏虞，系系闽省全局；庆端已饬福宁镇抽调兵丁驰赴福鼎，听候道员曾宪德调遣。着徐宗干就近调度，以顾根本。耆龄由粤赴闽，刻下应已赶到；昨谕於闽、浙交界驻紮。着俟抵浦城後，与庆端筹商，或分军兼顾温、处，总须视贼所向，力遏凶锋；不可稍存畏葸，致滋贻误。昨据左宗棠奏：寿昌、龙游之贼，复窜衢郡；该抚拟亲往督剿，自为力固江、闽门户起见。惟温州十分吃重，该抚亦应妥筹兼顾；着即与庆端等会商调度，毋使稍有疏失。其蒋益澧、刘培元所部已抵何处？仍即飞催前进，以厚兵力而资调遣。将此由六百里加紧各谕令知之。
福建巡抚徐宗干奏：军务未平，请将本年恩科乡试，展至十月举行。从之。
予福建彰化伤亡道员孔昭慈祭葬、世职加等。
十七日（戊戌），以福建水师出洋捕盗出力，予副将吴鸿源优叙，赏把总林天从蓝翎；余加衔、升叙有差。
二十七日（庚戌），谕〔内阁〕：徐宗干奏：（请将被参之司道各员，分别解任、革职讯办）等语。福建布政使裕铎、署按察使刘翊宸，均着解任，听候查办。道员章琮、知府胡斌，均着先行革职；提同各局员及书吏人等，严讯究办。原任江西知府、升授四川成绵龙茂道锺峻，着江西、四川等省各督抚饬令该员迅速前赴福建，归案查办。在籍知州姚镜图，着革职严行审讯。务期水落石出，毋任狡展。
谕〔议政王军机大臣等〕：徐宗干奏（妥筹防务及粤省划兑援浙饷银，已经填给执照，仍暂借洋商银两；台湾匪徒仍令曾玉明前往剿办）各摺片，浙省各路防剿及收复各府县情形，前经庆端奏报，业经谕令该督严饬秦如虎、林文察等军分路进剿，并於闽、浙交界实力严防。现据奏温郡击贼获胜，各军合攻处州、青田等处，当可得手；着严饬曾宪德等联络民团，妥筹守御。至台湾匪徒尚踞彰化，商艘不能通行；各营台勇闻变，不无内顾，诚恐别生事端。即着徐宗干飞饬曾玉明仍赴泉州，统兵前往剿办；务期恩威并用，将该匪迅速平定，以清台境。其粤省应解援浙饷银由商人划兑一节，粤省本有应协浙省之饷、亦有欠解闽省之饷，且各该商人於各口均有应纳税项；若概行汇借，将来各省效尤，难保不致发生轇轕。所称洋商向义凑借之语，洋人视利最重，亦难保不致纠缠。该抚所奏议定利息，分期归还；其利息作如何计算？其归还时如何办理？着详细具奏。嗣後於饷需一切，务当妥为通筹，期於无弊；不得仅顾目前，率行汇借，致启弊混之渐。将此由五百里谕令知之。寻奏：汇借洋商银两，议由闽、粤两海关税项内分月扣还，息银在通省捐廉项下提补。下部知之。
六月初四日（乙卯），谕议政王军机大臣等：庆端奏（温州、松阳剿贼获胜）及（查明台湾会匪滋事情形）各摺片，据称（窜扰瑞安之贼分踞桐岭等处，经官运连日剿击，毙匪多名）等语。该匪归并青田，计图窥犯闽疆；着庆端督饬秦如虎等迅速进剿，毋令阑入。其松阳踞逆负嵎抗拒，经林文察等督军屡捣贼垒，正在得手；即着催令该总兵等迅图攻克，毋任久踞。台湾会匪占踞县城，分股肆扰；前据徐宗干奏，该匪尚踞彰化，业经谕令飞饬曾玉明仍赴泉州统兵前往剿办。兹据奏称：林向荣等联络泉庄，军威已振；着庆端即咨商徐宗干调度策应，迅殄群丑，规复县城，以清海疆。本日庆端奏参挑派兵丁不慎之副将石栋等，业经照所请明降谕旨，分别摘顶、革职示惩。惟此项提标兵一千名，何以秦如虎统领剿办平阳贼匪，即所向有功；迨经张启煊调派，则纷纷溃散？庆端但归咎於石栋等挑派不慎，并未将张启煊劾参；是但治其未而不能治其本，恐无以服将士之心。仍着庆端将此次弁兵溃散，是否由於张启煊不善调遣之故？查明一并参办，毋稍姑容。将此由五百里谕令知之。寻奏：瑞安兵溃，实由石栋挑派不慎，兵弁违令误机；并非张启煊不善调遣。报闻。
以出洋获盗，予福建副将吴鸿源以总兵官升用。
以派兵不慎暨闻警溃退，摘福建护提督副将石栋顶带，革游击吴镇江等职；外委庄元升等革职讯办。
秋七月初五日（丙戌），以候补副将林文察为四川建昌镇总兵官。
初十日（辛卯），谕〔议政王军机大臣等〕：徐宗干奏（筹办台匪情形）并（遵查被参各员劣蹟）各一摺，彰化匪徒分犯嘉义、鹿港等处，虽经官军击退，究未痛加剿洗；逆首戴万生踞守县城，匪众尚多。曾玉明等已由鹿港登岸，并有军功施九挺等募勇协剿；即着徐宗干激励将士，迅将彰化克复，以倾贼巢。倘台匪肃清，在事官绅必当破格奖励；若日久无功，亦必从严惩处。着该抚传知在营官绅克期剿灭，毋稍迁延。其所需军饷，并着由省筹解。参将林文明激於义愤，愿赴台助剿，颇堪嘉尚；即着该抚咨调台勇一千名交其统带，迅速前往。林文察在浙剿贼，朝廷察其奋勇，昨已特简四川建昌镇总兵；并着徐宗干传谕林文明，使知朝廷衡功示赏，不遗在远。若该员奋勉图功，必能仰邀殊恩，以副期望。知府李鼐等已照议革职，归案审讯。该员等劣蹟昭着，若不严行惩办，则官方吏治何由整肃。着徐宗干檩遵前旨，将该员等劣蹟迅速查办，从严惩治；不必候耆龄到闽，致涉迁延弥缝。该抚以降调之员，特旨起用封圻，受朝廷特达之知；但当实心任事，不必有所瞻顾，致负委任。闽省吏治废弛已久，此次查办各员牵涉甚多，恐一时委用乏人；着该抚於通省各属员中留心访察，如有才德出众及洁己爱民之员，无论候补、实缺，出具切实考语密行陈奏，以备简用。将此由六百里谕令知之。
二十三日（甲辰），谕〔议政王军机大臣等〕：耆龄奏：（行抵浦城防所，业经庆端将闽省援浙各军移交接统。总兵秦如虎等节次由青田等处剿贼获胜，温郡肃清；收复松阳、宣平，贼窜金华。现在处州贼势已衰，大股悉聚金华境内，亟应乘机进剿）等语。耆龄由广赴闽，沿途迟滞至数月之久。现在驰抵浦城，接统庆端所部各军；本日复经简放闽浙总督。膺兹重任，应如何矢发天良，力图报称！着即督饬秦如虎、吴鸿源、林文察等军及所带粤勇规复处州郡城，直逼金华，大张挞伐；联络衢郡楚军声势，与左宗棠会合分路夹击，以为恢复全浙之计。遂昌收复之後，汤溪、龙游两县尚有巨股逆匪屯聚；迅即催督林文察与已革道员廖士彦等军奋力进攻，一经得手，即与衢州声息相通。缙云甫经收复，又为另股逆匪窜入；亦即饬令道员苏镜蓉激励民团，迅图扫荡。温、处剿贼，尚为得手；各属民团，义旗竞举。耆龄等务当迎机鼓舞，毋得稍有遏抑，以顺人心而作众志。闽省边境如福鼎等处与浙江边界毗连，仍须防贼突窜，以固疆围。庆端现放杭州将军，一时不能到任；着即暂留闽省防所，帮同耆龄筹办防剿。台湾彰化匪徒未平，总兵曾玉明等带兵已抵鹿港，设法进效；并着饬令该总兵等迅图蒇事。耆龄另片奏：（军务布置稍定，即行晋省）等语。浙省军务正当吃紧，该督甫经到防，正当策励诸军，迅筹进剿，岂可稍涉松劲！所有交查各件既经派员赴省访查，尽可与徐宗乾往返咨商，迅速查明，确实具奏。该督即毋庸回省，一意剿贼，以副委任。将此由六百里各谕令知之。
以闽浙总督庆端为杭州将军、广东巡抚耆龄为闽浙总督。
二十四日（乙巳），两江总督曾国藩等奏：福建水师提督杨载福请更名岳斌。报闻。
二十七日（戊申），谕〔议政王军机大臣等〕：徐宗干奏（省北解严，酌撤兵勇并筹议备御事宜）各一摺及庆端片奏（请撤红单船）等语。浙江温、台两郡业已肃清，闽省边界及温、台等处乡团颇称得力，足资防守。闽省西北两路水陆兵勇三万余名虽经撤退四千余名，而秦如虎新募楚勇二千复经到防、耆龄所派艇船十号及随带陆兵四、五千名先复抵闽，饷需势难为继；自应裁汰冗兵，以节饷源。着耆龄、庆端即饬闽军水陆各营将领将所部兵勇认真简阅，再加裁减，务令尽去冗兵，悉成劲旅；庶一兵得一兵之用，於饷需亦可节省。至该抚所筹备御事宜，如陆路兵团扼守隘口，及沿海绅民办理保甲团练，并挑选精兵练习火器，及查奖出力练民，不必另筹饷项别为一军等情，办理均属周妥。该督、抚务宜派委公正绅耆督带乡团，一切调度赏罚，悉令地方官主持；庶不至约束难周，事後亦易遣散。耆龄所派红单船十只现已驶赴五虎海口，惟该处已有副将颜青云统带闽省师船驻守，且宁波已经克复，闽海防务亦较前稍松，自可酌撤以节糜费。红单船广勇与闽安战船之泉勇素不相洽，恐因聚处互斗，别酿事端；且红单船勇嗜利轻义，往往与贼匪勾结，约束非易。着耆龄察度情形，酌量裁撤。如果有别须调遣、应行留用之处，务应申明纪律，严加约束；毋令别滋事端，致生枝节。徐宗干另片奏查办交审参案情形，其已经到案审讯各员，即着严切确究，随时奏结，与耆龄函商定拟速奏。庆端等所奏（台湾道、府借用洋商银两，请抵闽海关税）一摺，洋商银两本不应借用抵税，且闽海关税银，有提解京饷要款；该道、府等何得辄行擅借洋商银两，将此项关税扣抵！嗣後该督、抚等务宜严饬各沿海地方官，毋许再行提借，致误要需。将此由五百里各谕令知之。