三年后，杰西卡的改造正式开始。
　　培养槽里的男孩被迅速结束生命，这个男孩死的时候十分地安详，体内发育完成但没有发育成熟的器官被取出。
　　“媒介的情绪会干扰植入器官的发育，所以我们设计了一个真实的谎言，那个阉割他的邪恶教会被邪恶绿皮毁掉，他被我们从邪恶绿皮手里救出来，他那残破的身躯将作为培育死亡天使的容器，他的意志将随着基因种子化身死亡天使传承下去。怎么可能嘛？没有发育成熟的基因种子是没有用的，还好曼德勒提供了两个基因种子，哦呵呵呵呵……”荷诺莉亚内心发出女王式三段笑。
　　“赖皮蛇，你觉得手术会成功吗？”
　　“会！”
　　“气势不够！要有给车子刷红漆时那种一往无前的气势！我们的手术会成功吗？！！！”
　　“偶寻思着手术一定会成功！Waaaaaagh！！！！”一股强大的气场从赖皮蛇体内迸射出来，直击杰西卡。
　　“那么手术就一定会成功，好了，赖皮蛇，请你离开，不要打搅我们手术。”
　　除了脑细胞以外的移植器官已经提前一个月植入了杰西卡体内，移植用脑细胞将在进行阶段六、阶段八和阶段十二的植入时分批次植入以修复杰西卡受损的大脑。在丹药、生化医疗软膏和纳米机器人的共同作用下大幅杰西卡的耐操能力，身体状况已经可以接受进一步改造了。
　　“我是否该告诉赖皮蛇杰西卡中尉的大脑都受损了，现在是植物人状态，就算手术成功也不一定醒的过来。”
　　虽然现在帝国拥有在一年之内就制成一个星际战士的技术，但是欲速则不达，这种方法调制出的星际战士都有那么一点儿可治愈但需要长期调养的小问题，沙马尔采用的是最原始也是最稳妥的十年改造法，当然，由于生化医疗软膏和纳米机器人的出现，十年改造法不算是“最原始”的了。
　　阴性丹药逐步地被使用在杰西卡身上，雌性激素也被大量注入杰西卡体内，纳米机器人已是全力运作，这一切都是用来修正植入器官的发育，使之可以和女性身体契合，同时植入器官也在修正着杰西卡的身体，就看最后是谁推倒谁了。
　　到了这一步，荷诺莉亚和沙马尔除了等待就是等待，两个人轮流值班，荷诺莉亚的坐功一向不好，要让她什么事都不做就这么坐一个钟头以上除非某位美女贡献出自己的大腿或是某个萝莉坐在她的腿上。荷诺莉亚很快就找到了新的打发时间的方法，不得不说，人是逼出来的。
　　荷诺莉亚通过一个程序跟踪了绿土贝系统的数据传输，发现绿土贝系统轨道防御子模块的数据流最后都流向了帝皇纪念堂，那儿可能就是绿土贝系统的主机所在，荷诺莉亚趁沙马尔值班的时候去了一趟纪念堂，发现绿土贝系统的主机硬件很多都是硬凑上去的，与软件有很多地方不配套，软件也是不完整的，除了轨道防御子模块还在以外其它的模块都不见了，也亏得软件是不完整的，否则这个绿土贝系统早就因为软硬件不协调而崩溃了。
　　荷诺莉亚利用脑内的量子计算机占了绝对优势的运算速度破解了绿土贝程序，并将绿土贝的源代码复制了下来，荷诺莉亚惊异地发现雷吉恩系统个人版的硬件和绿土贝的源代码很般配，反正自己脑袋里的量子计算机的硬件坏得只剩下“恢复大脑机能”这一基础功能了，OS也不知道被谁给格掉了，所幸雷吉恩系统“恢复大脑机能”这一功能是不需要OS的即插即用功能。既然两者这么般配，就用被迫成为开源软件的绿土贝作为雷吉恩系统的OS好了，既然OS换了就不能叫“雷吉恩”好了，荷诺莉亚承认自己没有取名天赋。
　　由于绿土贝的主程序现在只剩下源代码了，荷诺莉亚每天都在和复杂的编程语言作战，可惜编程并不是荷诺莉亚所长，费了老大的劲儿才倒腾出一个V0。213beta版。
　　皇帝纪念堂有很多电子装置并没有和绿土贝系统连线，荷诺莉亚在一次调查中发现了一个手提箱样的装置，这个装置上用钢印打上了这么一行隶书中文——盘古斧。这个装置的结构保存得相当完好，但是装置本身由于年代久远已经成为一堆废铁。荷诺莉亚扫描了这个装置的结构，发现这个装置像极了机械教火星总部保留的一个损STC——伊甸园创造器。这个STC模板在荷鲁斯之乱时关于净水芯片的部分损坏了，但这里的这个盘古斧系统的结构是完好的，从名字上推测功能得到了强化。
　　这个盘古斧系统并没有用来建设一个定居点，而是被用作另一个遍布整个纪念堂的大型装置的核心，这个大型装置也损坏了，但是荷诺莉亚还是从当地的童谣中找到了这个大型装置的功能——净化饮用水。难怪这个世界最早皈依皇帝的地方是这座城市，不过帝国殖民舰队干嘛不使用伊甸园创造器作为净水装置的核心。
　　荷诺莉亚有了新欢忘了旧欢，一下班就泡在皇帝纪念堂试图修复这个净水装置，无所事事的瓦塞克也粘了过来，整天泡在皇帝纪念堂。而法务部出于争取民心的考虑，对师徒二人提供了资金与物质支持。
　　日子就这样一天一天过，直到一个召来腥风血雨之人来到这里。
　　荷诺莉亚从花生屯的童谣推测出，帝国殖民舰队到达森林王国时，这里充斥着遮天蔽日、肆虐无忌的尘埃，地表上古代大厦的遗迹星罗棋布，以神话般的科技铸就的雄伟纪念碑在时间的洪流中屹立不倒。这个行星的地层中包含者由黑硬琉璃质构成的平原，还有连绵不绝且被严重污染的沙漠。曾经的大海只剩染毒的湖水和剧毒的淤泥，现在被死灰层覆盖着。森林王国的地表上变种人与掠夺者横行，少量的人类幸存者结成一个又一个或大或小的聚落挣扎求生。
　　帝国殖民舰队来了之后，在花生屯建造了一个净化水装置，又在森林王国后来的绿洲地区找到了一种可以适应高辐射环境的植物，他们利用净化水装置和植物逐步改造并控制了整个森林王国。
　　不知为何，这一段历史以地方童谣的形式语焉不详地流传了下来，并未录入森林王国地方志。这个童谣有好几个版本，但都有意无意地提到了一名身材高大、身怀大能的黑发金肤美男子，童谣对这位美男子的能力描述说明这位黑发金肤美男子不是皇帝。
　　“有些事情我知道自己不知道。”荷诺莉亚如是说。