乙酉，迎王於江浦。丁亥，百官迎见於龙江关在江宁县西仪凤门外；王素服角带，哭。五月戊子朔，王谒孝陵、奉先殿，出居内守备府。群臣入朝，王色赧欲避；可法曰：王毋避，宜正受！既朝，议战守。可法曰：王宜素服郊次，发师北征，示天下以必报之义。王唯唯。明日，再朝；出议监国事。张慎言曰：国虚无人，可遂即大位！可法曰：太子存亡未卜；倘南来，若何？刘孔昭曰：今日既定，谁敢复更！可法曰：徐之。乃退。又明日，王监国。
续通监纲目於元顺帝至正十五年明太祖起兵之後，即书元以去其正统，此大不可者。至崇祯甲申以後本朝已定鼎燕京，而福王虽偏安江南，亦即逾岁被执，明亡；则甲申五月以後、乙酉五月以前，明之正统虽未亡而明之偏安已不保，故用元顺帝十五年以後之例书明以别之。然固不如续纲目之左袒也。
明福王以史可法、高弘图、姜曰广、王铎孟津人并为东阁大学士，入阁办事；马士黄为东阁大学士，仍总督凤阳等处军务。
时廷推阁臣，刘孔昭攘臂欲并列；众以勳臣无入阁例，遏之。孔昭勃然曰：即我不可，马士英何不可？乃并推士英。又议起废，竞举郑三俊、刘宗周、徐石麒；孔昭举阮大铖，可法曰：先帝钦定逆案；无复言。越二日，拜可法、弘图、士英并为大学士，可法仍掌兵部事、士英仍督师凤阳。姜曰广先以曾有异议，不用；及再推，词臣乃以曰广及王铎等名上，遂与铎并命。又以张慎言为吏部尚书，起刘宗周为左都御史宗周闻京师陷，方召募义旅讨贼；未发而福王立，遂起故官、徐石麒为右都御史寻改吏部尚书，兵部尚书张国维以原官回部协理京营戎政庄烈帝令国维赴江、浙督饷，出都十日而城陷；至是，召还；余皆迁擢有差。
明福王称帝於南京。以史可法督师江北，召马士英入阁办事。
史可法定京营制如北都故事，侍卫及锦衣卫诸军悉入伍操练；锦衣东、西两司房及南、北两镇抚司官不备设，以杜告密、安人心。
时马士英旦夕冀入相，及督师凤阳命下，大怒，以可法所与士英七不可书奏之王，且令高杰等疏趣可法视师；而自拥兵入觐，拜表即行。可法遂请督师，出镇淮、扬；王命以便宜行事，各镇并听节制。
十五日壬寅，王称帝於南京。癸卯，士英即入阁佐理，仍掌兵部尚书事。
乙已，可法陛辞，请以总兵刘肇基字鼎维，辽东人、于永绶、李栖凤、卜从善、金声桓字虎夫，辽东卫人等随征；从之可法启行，即遣使访崇祯帝后梓宫及太子、二王所在。复奉命祭告泗、凤二陵；祭毕，上疏言：凤、泗境中蒿莱满目，陛下见之，当益悲愤。愿慎终如始，战兢惕厉，无时怠荒；二祖、列宗，必默佑中兴。若不思远略，威断不灵，东南一隅未可保也！王嘉答之。时李自成弃京师西走，青州诸郡县并杀伪官，据城自保；未知南都拥立事。可法请速颂监国、登极二诏，慰山东、河北军民心。开礼贤馆，招四方才智；下僚有才被弃者，亦悉举任用之。以监纪推官应廷吉领其事，幕府称得人。
明分淮、扬、凤、庐为四镇，以黄得功、刘良佐、刘泽清、高杰领之。
时议分江北为四镇，刘泽清辖淮、海，驻淮北，经理山东一路；高杰辖徐、泗，驻泗水，经理开、归一路；刘良佐辖凤、寿，驻临淮，经理陈、杞一路；黄得功辖滁、和，驻庐州，经理光、固一路。仍进得功靖南侯，封杰兴平伯、泽清东平伯、良佐广昌伯。
时得功、泽清、杰争欲驻扬州，杰先至，固欲入城；扬州民畏杰，不纳。杰攻城急，日掠村厢妇女，民益恶之。知府马鸣騄襄城人、推官汤来贺南丰人坚守月余进士郑元勳家城中，身诣杰营，责以大义；杰颇感悟，为敛兵五里外，城西北得暂启门以通薪。而守城者负约，数以矢石中杰兵；杰兵复进，扬人竞疑元勳通杰，遂遇害——郑元勳，敛县人，杰知不可攻，意稍怠。而泽清亦大掠淮上，临淮不纳良佐，军亦被攻。王命可法往解，得功、良佐、泽清皆听命；乃诣杰。杰素惮可法，夜掘坎千百埋暴骸；旦日谒可法帐中，词色俱变，汗浃背。可法坦怀待之，接偏裨以温语；杰大喜过望。然杰亦自是易可法，用己甲士防卫，文檄必取视而後行。可法夷然，为具疏屯其众於瓜洲，杰又大喜；可法乃开府扬州职方主事万元吉请奉诏宣谕四镇，且发万金犒高杰，令保江、淮。乃渡江诣诸将营，约共奖王室；诸将嫌渐解。廷议以元吉能辑诸镇，擢太仆少卿，监视江北军务。
四镇中惟黄得功犹具勇敢朴诚之气；芜湖身殉，始终殊有足观。若高杰攻城掠民，膺分阃而行同寇贼。以史可法之铮铮佼佼为其素所心惮，正当乘此变色汗背时，一一声罪切责，折其骄蹇之萌；且尔时三镇帖然听命，杰即无状，未敢遽行称乱也。乃一意坦怀相与，不惟不知感恩，转令心生易视；良由明季陋习专尚调停，推其末流，贤者不免。彼万元吉之賫金出犒、用博迁官，又无论矣。语云：一木难支；况大厦已倾之後，庸有冀乎！
明进封左良玉为宁南侯。
先是，庄烈帝韶封良玉宁南伯，许功成世守武昌，命给事中左懋第字萝石，莱阳人便道督战事在是年正月；良玉乃条日月进兵状以闻。疏入，未奉旨而京师陷。福王立，诏至，其部下有异议，不欲开读；巡抚何腾蛟字云从，黎平卫人急诣良玉所争之，而良玉已从正纪良玉所置官名卢鼎言开读如礼。诸将尚汹汹，欲引兵东下；良玉恸哭不许，尽出所藏金银、采物散之诸将曰：此皆先帝赐也。受国厚恩，祸变至此，良玉何心独有之乎！於是诸将噭然皆哭。副将马士秀奋曰：有不奉公令、复言东下者，吾击之！以巨舰置炮断江。众乃定。会王命进良玉爵为侯、廕一子锦衣千户，以上流之事专委良玉；制书到楚，而良玉贺表亦至。时李自成败於关门，良玉得以其间稍复楚西境之荆州、德安、承天；而腾蛟及总督袁继咸字季通，宜春人居江西，皆与良玉善；南都倚为屏蔽良玉兵八十万，号百万；前五营为亲军，後五营为降军。每春秋，肄兵武昌诸山；一山帜一色，山谷为满。军法：用两人夹马驰，曰过对；马足动地殷如雷，声闻数里。诸镇兵惟高杰最强，不及良玉远甚；然良玉自朱仙镇之败，精锐略尽。其後归者多乌合，军容虽壮，法令不复相摄。而是时良玉亦老且病，无出兵意矣。
明分置应天、苏松巡抚。
以左懋第为应天安徽巡抚、祁彪佳字宏吉，浙江山阴人为苏松巡抚。
时苏州诸生檄讨其乡官从贼者，奸民和之，少詹事项煜及大理寺正钱位坤、通政司参议宋学显吴县人、礼部员外郎汤有庆长洲人之家皆被焚劫；常熟又焚给事中时敏家。彪佳请议从逆诸臣罪，而治焚掠之徒以加等；从之时高杰驻瓜洲，跋扈甚。彪佳克期往会；至期，风大作，杰意彪佳必无来。彪佳携数卒，冲风渡；杰大骇异，尽撤兵卫，会彪佳於大观楼。彪佳披肝膈，勉以忠义，共奖王室；杰感叹曰：杰阅人多矣！如公，杰甘为死。公一日在吴，杰一日遵公约矣。共饭，而别。
明以忻城伯赵之龙永乐功臣彝八世孙总督京营戎政。
明淮扬巡抚路振飞字见白，曲周人击贼党董学礼於宿迁，走之。
先是，流贼陷山西，振飞遣将十七人分道防河，由徐、泗、宿迁至安东、沭阳；且团练乡兵、犒以牛酒，得两淮间劲卒数万。至是，河南副使吕弼周邹平人为贼节度使，进逼淮上；进士武愫泾阳人为贼防御使，招抚徐、沛；而贼所遣伪制将军董学礼等据宿迁。振飞击擒弼周，愫走学礼竿弼周法场，命军士人射三矢，乃解磔之；缚愫徇诸市，鞭八十，槛车送南京诛之。会马士英欲用所亲田仰庐陵人为淮扬巡抚，乃罢振飞。振飞亦遭母丧，无家可归；遂流寓苏州振飞在淮安，与巡按御史王燮颇号召义士，同心戮力；自振飞既去，王燮亦陞右佥都御史，巡抚山东。而刘泽清来居淮城，威福自擅，散遣义士；其桀骜者藉之部下劫掠，村落一空。又大兴土木造宅，壮丽僭拟皇居，与田仰日肆欢饮；士民愤怨。时山东郡县已归我大清，王燮亦不能往，但逡巡河上而已。
六月，明追上崇祯帝后谥号。
命谥崇祯帝曰烈皇帝，庙号思宗赵之龙欲倾高弘图，以思非美谥，上疏纠驳；寻改曰毅宗；周后曰孝节皇后。又追谥其祖母郑贵妃曰孝宁太后、考福恭王曰恭皇帝寻改谥孝皇帝，尊其墓曰熙陵，别立专庙。上嫡母邹氏尊号曰恪贞仁寿皇太后时太仆少卿万元吉请修建文实录，复其尊称，并还懿文追尊故号，祀之寝园，以建文配；而速褒靖难死事诸臣，以作忠义之气。命从之。乃追复懿文太子庙号，追谥建文帝曰惠宗让皇帝；复封其弟允燧等为王。并上景帝庙号曰代宗，改谥孝宗张后曰孝成皇后。方孝孺等皆为赠谥、立祠。又闻崇祯太子及永、定二王皆为李自成所害，乃追谥太子曰献愍、定王曰哀、永王曰悼。
明召阮大铖陛见。
大铖名挂逆案，失职久废。崇祯末，以避流贼，居南京；颇招纳游侠，为谈兵说剑，觊以边才召。无锡顾杲、吴县杨廷枢等皆复社中名士，方聚讲南京；恶大铖甚，作留都防乱揭逐之。大铖惧，乃闭门谢客，独与马士英深相结。福王既立，士英秉政，招权罔利，日事报复。时高弘图、姜曰广、张慎言等皆以宿德在位，将以次引海内人望；而士英必欲起大铖，因荐大铖知兵。初，大铖在南京，与守备太监韩赞周昵。及北都既陷，中官悉南奔，大铖因赞周遍结之，为群奄言东林当日所以危贵妃、福王者以潜倾史可法等；群奄更极口称大铖才。士英亦言大铖从山中致书与定策谋，为白其附璫赞导无实迹；遂命大铖冠带陛见。大铖乃上守江策，陈三要、两合、十四隙疏，并自白孤忠被陷，痛诋孙慎行、魏大中、左光斗，且指大中为大逆。於是大学士姜曰广、侍郎吕大器、怀远侯常延龄开平王遇春十一世孙等并言大铖逆案巨魁不可召，给事中罗万象、应天府丞郭维经字六修，江西龙泉人、大理寺丞詹兆恒字月如，广信永丰人亦各言逆案不可翻兆恒疏略言：先皇手定逆案，芟刈群凶，第一美政。今者大仇未报，乃忽召大铖，还之冠带，岂不上伤先帝灵、下短忠义气哉！疏奏，命取逆案进览。兆恒即上进，而士英亦以是日进三朝要典；乃切责万象等。弘图复请下九卿会议，亦不听。
明吏部尚书张慎言罢。
时大起废籍，慎言荐前大学士吴甡、前尚书郑三俊，王命召甡陛见。一日，朝罢，诚意伯刘孔昭、忻城伯赵之龙群诟於廷，指慎言及甡为奸邪；叱吒彻殿陛。给事中罗万象言：慎言平生具在，甡素有清望；安得指为奸邪！孔昭等伏地痛哭，谓慎言举用文臣、不及武臣，嚣争不已；孔昭至欲手刃慎言，韩赞周呵之，乃止。既退，又疏劾慎言，极诋三俊；且谓慎言当迎立时阻难、怀二心，乞寝甡陛见命，且议慎言欺蔽罪。慎言疏辨，因乞休。时两解之万象又言：首膺封爵者，四镇也；新改京营，又加二镇衔，何尝不用武！年来封疆之法，先帝多宽武臣；武臣报先帝者安在？祖制以票拟归阁臣、参驳归言官，不闻委勳臣以纠劾也；使勳臣得兼纠劾，文臣可胜逐哉？史可法奏：慎言疏荐无不当，诸臣痛哭喧呼，灭绝法纪；恐骄弁悍卒，益轻朝廷！御史王孙蕃言：用人，吏部职掌；奈何廷辱冢宰。弘图等亦以不能戢和文武，各疏请罢，俱不允；而吴甡亦竟不复召。慎言乃再疏乞休，遂许其请；且谕之曰：晋疆未复，卿已无家可归；沿途侨寓需召！慎言遂流寓芜湖、宣城间至国亡後，疽发於背，戒勿药；卒。