〔九月丁卯〕，户部题覆福建新旧关税凡十二处以添设红夷兵饷——从抚臣南居益请也。
〔十二月壬午〕，琉球国中山王世子尚丰遣官齎捧谢恩表文、入贡方物，请乞封典。下所司。
·〔天启六年四月辛巳〕，巡按浙江御史刘之待题：‘海寇林七老等纠合红夷，伪称王号，扬帆海面，御货杀商；该抚、按亲诣督饬道将率官兵贾勇攻剿，殄厥渠魁；救被掳者，悉令生还。宜论功升赏。阵亡、被伤军士，乞酌量优恤’。章下所司。
〔五月丙午〕，巡抚福建朱钦相疏言：‘遵旨将前新设钦依中军千、把总等官尽行裁革，改用名色；总计每年减丁廪银二千二百一两有奇，解助大工’。报闻。
〔戊申〕，福建巡抚朱钦相言：‘该省西库贮银三十七万〔两〕，除剿夷开除外，尚有实银一十九万三千余两’。上命尽数解进，不必存留。
〔七月丁亥〕，命工部催解福建存积银两以助大工。初，福建布政司西库贮银三十七万两，备防海之用；以红夷发难，调兵增饷动支开销十七万两，尚存二十万两。布政使沈演以闻，上即命解进。寻以解官刘日珩迁延未到，传谕趣之。
〔九月丙子〕，巡抚福建右佥都御史朱钦相言：‘近奉明旨，停止榷税；此浩荡皇仁，臣子敢不仰体。惟是闽中税分新旧，海澄洋税与福州税课司从来额征以给兵饷。且彭湖向为红夷窃据，今筑城增兵，远海长戍，俨然一重镇，兵不可撤；则舍洋税，饷无所出。相应仍遵前旨，以济急需。若闽安、竹崎等关，则万历年间新开之税也；新税已停，无容再议。但未奉旨之先，已收过闽安等税四千余金；倘留抵新饷，固出特恩。若以大工浩烦，仍当解助；非臣所敢妄觊也’。得旨：‘海澄洋税与福州税课司从来额征以给兵饷，准照旧行，不得与新税同免。其收过闽安等税银四千余两，仍着解进以助大工’。
〔十月丁卯〕，升山东布政使司右布政使朱一冯为都察院右佥都御史，巡抚福建地方。
〔十一月〕丁丑，兵部尚书冯嘉会覆”福建巡抚右佥都御史朱钦相疏“言：‘福建新设旗鼓中军备、总共二十七员，今奉明旨裁革。然武弁之用钦依，所以通武弁之穷、亦以塞侥幸之窦，以用人之权归之朝廷也。除巡视海道中军等缺听该抚选委名色外，查泉州新旧营等缺，括其兵数、衡以地险，仍当照旧用钦依。见任者照旧管事，咨回着复原任’。从之。
戊戌，先是，闽中自红夷发难后，奸民随处生心，招徒结党，称王称国；而杨六、蔡三、钟六等拥众海上几数千人，杨六尤桀黠称雄。福建巡抚朱钦相檄总兵俞咨皋会兵进剿，贼稍稍遁入东粤；督臣商周祚亦大发舟师，南北夹击，贼始穷促。于是蔡三走日本，钟六为杨六并杀，亦屏息东番；杨六遂率其党三千余人、大小战船七十二只，诣俞咨皋乞降；遣指挥王应选宣谕，一时归农者二千人，杨六等愿剿贼自效。抚臣朱钦相以闻，兼叙总兵俞咨皋等将士之功。兵部尚书冯嘉会因言：‘闽昔患夷，今乃患寇。昔患贼与贼合，今患贼与民合、且与兵合。何以言之？内地奸宄，窟海为生；始而勾引，既而接济，甚至代为输转：所谓”贼与民合“者此也。自红夷已靖，闽以乏饷故，尽撤新兵。凡新兵皆市井亡命，狗吠而鸡鸣者；一隶行伍，心胆益粗。撤之使去，去将安适？计有浮梁剽掠而已。其与我兵向皆熟识，以其类群间同猫鼠：所谓”贼与兵合“者此也。夫御海贼与御陆贼异，御今日海贼又与御昔〔日〕海贼异。闽北自沙埕、南达南澳，上下几二千里。其人皆沿海而居，烟火相连、市镇互错，贼无时无处不可焚掠。而我以数千兵碁置其间，疏若晨星，难顾首尾；即欲合兵夹击，而彼已扬帆于穷岛绝屿之外。非若平原峻岭，其来有路、其去有方，可以设伏据险而取也：所谓”御海贼与〔御〕陆贼异“者此也。闽负山阻海，地瘠民贫；田园甚稀，额征有数。往时藩司贮有备倭银两数十万以防不虞，日者红夷阑入，支费近半。旧藩臣沈演复以其余贮尽数入告助工，而藩库中无复有锱诛之遗矣；公私告匮，行伍从何充实？器械从何置办？船只从何增添？所谓”御今日海贼与昔日海贼异“者此也。今该抚、镇诸臣能使贼杨六等俛首革面，率众就抚；我且因而用之，分别列营，使贪使诈，计莫便焉。然必严为令曰：”若辈能杀贼自效，当贷若死；功多者为请于朝，叙赉有差。其有抗违及骚扰者，治如法“。如此则镇臣之威灵，真足以制服诸贼；而为封疆、为桑梓之念，亦实足取信天下矣’。得旨：‘这就抚海寇散者解网贷罪、用者悬格待功，如议行。余党纵横，还严行申饬。但能使民不与寇合、寇不与兵合，即是防御之略；不得苟且塞责’。
·〔天启七年三月〕丁丑，浙江巡抚潘汝祯言：‘闽、浙比邻，忽有闽人王清等驾巨舟，称闽省义民，联〈舟宗〉越境；恐其假托横行，防贼者即自为贼。伏乞申严海禁’！得旨：‘浙、闽俱濒海邻倭，向虑奸民勾引，各厉禁船只不许往来。突有王清统率多船入境，停泊行使；是否剿贼？是否奉闽抚明文？既经该抚移咨闽中查究外，以后还着各遵旧禁，严缉彼此境上流突，以绝地方奸利之民勾倭生端’。
〔八月甲午朔〕，升都司佥书管湖广洞庭守备事刘承胤为福建彭湖游击将军。
癸丑，巡抚福建朱一冯言：‘年来海上啸聚，如萨子马、钟六老眈伺境外者无论，在福属则有朱屎老所在流突以至蔡三老向为中路所逐，未几，二年复归顺。镇东大小址、草屿之间，以贼船报警。今所在擒斩累累，计荡〈酋咸〉匪朝伊夕。所虑者，剧贼郑芝龙与酉二老也。日者中左、铜山、漳浦、诏安等处所在告急，臣檄募澳民为奇兵，而舟楫未备，不能飞渡也；檄练乡兵，而室庐自保，不能远赴也；檄沿海营兵、省城营兵及标下亲兵应援，而闻警东驰、贼复西骛，疲于奔命。臣一身策应，四面支撑；盖受事三月而屡九回百结者，不啻岁余矣。且天下止有”恨贼、畏贼“之人心，而闽中独有”德贼、附贼“之众志。计一大创之，非厚集师武力不可。而闽库无一镮之积，臣暂那藩司钱粮以应；而钱粮自有正项，那借将何偿还！臣固不能数乞贷于该司，而道将又不能不责办于臣。其责办于臣者，如债家之征通，才有不应，误事之虞立至；而臣乞贷于该司者，如寠人之抱券，前尚未偿，指囷之口难开。闽省钱粮额数原少，如京、边以及加派辽饷、助工等项，臣何敢辄请！而杂派各项银两，输之度支，不过九牛之一毛；而留之本省，便是涸鲋之斗水。伏乞皇上轸念海邦，俯捐遗秉滞穗，使臣得为数米之炊而不至为无米之炊。若此区区者而并靳之，则不如索臣于枯鱼之肆，而闽事去矣。抑贼所掠金钱满载，遇诸生则馈以赆，遇贫民则给以钱；重偿以招接济，厚糈以饵间谍：使鬼通神，人人乐为之用。此时虽得十数万金钱造巨舰、铸大铳、募死士、益精兵，犹恐胜败之数，我与贼共之。而臣以措大之锱诛、敌御货之泥沙，不待舳舻相接，而贼已揶揄臣之襟捉肘露，以为无如彼何矣’！得旨：‘闽省剧寇纵横，若不大加扫荡，后将何极！览奏，具见该抚灭贼固圉之意。所请钱粮系京、边及辽饷、助工等项干系上供，的不得那动。其杂派各项银两，准留该省听用动支为剿贼之费。事平之日，造册核销。此事养痈已久，该抚用心剿除，务期海氛尽扫，以称朕怀’。