昭忠祠
雍正二年谕：‘朕惟“周礼”有司勋之官，凡有功者书名太常，祭于大烝。祭法曰：“以死勤事则祀之”；凡以崇德报功，风励忠节也。我太祖高皇帝肇造鸿图、太宗文皇帝式廓区夏、世祖章皇帝奄有万邦，自创业以至定鼎，将帅之臣致命立功者不少。圣祖仁皇帝临御六十一年，中间歼灭三逆、永清朔漠以及平定西藏、台湾，虽天戈所指如疾风振槁，而师旅之臣捐躯马革及守土之官见危授命者，所在多有。迩者青海荡平、西域效顺，然自用兵以来将土奋勇前驱，亦有殁于行阵者。此皆尽忠报国之臣，朕甚嘉之、亦甚悯之！当于京师建立祠庙，春秋妥侑，世世血食。其偏裨士卒力战敌忾、舍生取义者，亦附列左右，用以褒崇大节、扬表芳徽，俾远近观听，勃然生忠义之心，于治道亦有裨益。仍令翰林官纂其籍贯事迹，各为立传，汇成一编，垂诸永久。九卿、詹事、科道悉心详议具奏。钦此’。遵旨议定：交兵部详考案卷，行文八旗、直隶、各省督抚，凡临阵捐躯、守土授命之文武诸臣以及偏裨士卒赤心报国、奋不顾身者，将籍贯事迹详晰缮册具奏。其建祠之处，交兵部于京城内相度地方，鸠工庀材建立祠宇；制造神牌，恭请钦定扁额字样，行令钦天监择吉悬挂。将文武诸臣之位，安设正祠；偏将士卒之位，安设两庑。入祠之日，太常寺前期奏遣大臣一人致祭。祭文由翰林院撰拟，祭祀事宜由太常寺豫备。每年春秋二祭，均由太常寺办理。仍交翰林院详稽“实录”、“国史方略”、各馆册籍，移取兵部清册，各为立传，汇成一编，垂诸永久。
乾隆五十四年议准：平定台湾阵亡浙江温州镇总兵贵林等官兵四千八百九十三人入祀。
六十年议准：办理台匪及剿捕苗匪各案被戕同知朱慧昌等官兵九十四人入祀。
道光十三年谕：‘上年冬间福建台湾逆匪张丙等戕官围城，贼党窥觊斗六门，屡次攻扰。署守备马步衢筑建围栅、开浚沟濠，与县丞方振声协力抵御；把总陈玉威乘贼未备，施抛火器以遏贼势。贼众夤夜纵火，蜂拥而入；马步衢等持刀巷战，各杀毙数贼，力竭遇害。方振声着加恩照阵亡知府例赐恤，赐谥“义烈”，赏给骑都尉世职。马步衢着加恩照游击例赐恤，赐谥“刚烈”，赏给骑都尉世职。陈玉威着加恩照都司例赐恤，赐谥“勇烈”，赏给云骑尉世职。幕友沈志勇赏给六品职衔，伊子沈联辉赏给七品职衔，均着加恩照例赐恤。俱入祀京师昭忠祠’。
又议准：剿办台匪阵亡副将周承恩入祀。
——以上见“钦定大清会典事例”卷四百四十九。
直省昭忠祠
嘉庆十年议准：剿捕台湾洋匪阵亡都司黄云台等七员、兵十一名入祀。
十五年议准：福建派赴台湾捕盗伤亡把总饶成基等二员、兵五名……入祀。
十七年议准：……福建派赴台湾在洋漂没外委刘元得一员入祀。
道光二年议准：福建台湾阵亡外委张坤有等十一员、淹毙兵五名、出洋遇贼被戕外委朱雄一员、兵五名入祀。
十三年议准：福建剿办台匪阵亡县丞朱懋护等二员、廪生古嘉会等二名、民兵一名、出洋淹毙外委谢得高等五员、兵一百三名入祀。
又议准：追捕台匪被戕知府吕志恒等二员入祀。
十七年议准：福建台湾捕贼被戕把总柯青山等二员、兵一名……入祀。
——以上见“钦定大清会典事例”卷四百五十一。
功臣专祠
嘉庆元年，钦奉高宗纯皇帝敕谕：‘大学士贝子福康安，秉性公忠，才猷敏练；扬历中外，懋着殊勋。年当弱冠，即出师金川，着有劳绩；曾赏给巴图鲁名号，特封男爵。嗣又平定石峰保、台湾、廓尔喀等处，宣劳边徼，屡奏肤功；复节次晋封至一等忠锐嘉勇公，简直纶扉，赞襄机务。且历任封圻以来，筹办地方事务，无不悉心整顿，经理得宜。此次督剿苗匪，涉历险阻，不辞劳瘁；亲带官兵，所向克捷。上年特降恩旨，赏戴三眼花翎，晋封贝子爵衔，仍带荣赏四字佳号。福康安年力富强，正资倚毗；乃当大功垂成之际，积劳成疾，遽尔溘逝，实深震悼！着晋赠郡王职衔，仍着于伊家宗祠之旁实为相度地基，建盖专祠，以时致祭，用妥忠魂。钦此’。遵旨建奖忠祠于东安门外，祀郡王衔大学士谥“文襄”福康安；岁以春秋仲月诹吉致祭，用素帛一、羊一、豕一、果实五盘、尊一、爵三。
十年谕：‘御前大臣领侍卫内大臣都统三等公额勒登保，秉志忠诚，夙娴韬略。从前朕在藩邸时，充谙达有年，小心勤恪。曾出师缅甸、金川、石峰保、台湾、廓尔喀等处，久经行阵，累立战功。嗣又平定苗疆，蒙高宗纯皇帝锡封侯爵。旋因教匪滋事，简畀戎行；始以迟缓获愆，终能奋勇克捷。自朕授为经略大臣，实力督师，冲冒雪霜，屡阅寒暑；身经百战，艰险备尝；将数万凶渠扫除净尽，三省地方咸臻安辑，实能为国宣劳。且其宅心公正，力矢清操；中外满、汉臣工及外藩蒙古等即素不相识者，亦人无闲言，尤为不可多得。是以特加恩奖，仍锡通侯，授以御前大臣，晋加宫保；并赐双眼花翎、紫缰，用昭殊锡。此次感患病证，即因积劳所致。目前启跸时，伊正当乞假，不克扈从前来；朕怀日切萦仅，屡命留京办事王大臣等往看病状，谕令安心调养，并亲解佩囊寄京赏给。昨谒陵礼成，特晋封为三等公；复命干清门侍卫庆惠驰往看视，赉赐荷囊、玉韘、鹿雉等物。方冀日渐痊愈，长被恩光。今据留京王大臣驰奏：额勒登保溘逝；披览遗章，实深震悼！念其一生忠荩，不禁涕泗交集。允宜宠锡饰终，以示酬庸。朕于回銮后新临祭奠，并着庆惠到京后将朕赉赐物件陈之幕前，烹饪赐酹；并加恩建立专祠，岁时赐祭。着禄康于地安门外相度地基，动用官项，营建祠宇；所有工程，即着禄康督率办理。钦旨’。遵旨建褒忠祠于地安门外，岁以春秋仲月诹吉致祭，用素帛一、羊一、豕一、果实五盘、尊一、爵三。
直省功臣专祠
道光十三年，敕建福建台湾县丞谥“义烈”方振声、署守备谥“刚烈”马步衢、把总谥“勇烈”陈玉威祠于斗六门。
咸丰五年，敕建福建彰化县知县高鹏飞祠于台湾县城。
——以上见“钦定大清会典事例”卷四百五十三。