五十四年奉旨：‘沿海小港查禁既严，凡有搭载前往台湾民人，非由正口无从径渡；恐不特胥吏、兵役等从中多索钱文，即守口文武员弁亦难保无通同染指。是私渡之弊或可禁绝，而勒掯卖放之端即由此起。总在该督、抚及台湾镇、道等督饬守口文武员弁实力稽查，随时严密。若查出胥吏、兵役人等婪索私放，即行严办示惩；不得视为具文，久而生懈。自此次立定章程之后，再有多索搭载船租饭食银两、故意刁难及得赃放行、私越海口诸弊，惟该督、抚及镇、道等是问，不仅将海口文武员弁从重治罪已也’。
嘉庆六年奏准：台湾南、北一带口岸如有私越之人，将不行查禁之口岸员弁罚俸一年。
——以上见“钦定大清会典事例”卷六百三十。
巡洋捕盗
乾隆五十九年奏准：台湾水师将弁按照巡期亲历各处，实力巡哨。遇有失事，若于巡期内将本境应行缉捕之犯能于疏防限内拿获及半者，免其议处；一案盗犯全行拿获者，准其加一级；疏防限外全获者，准其纪录二次；能首先拿获邻境劫掠盗犯一案、本任并无承缉逃者，准其送部引见。
——见“钦定大清会典事例”卷六百三十一。
外海巡防
康熙五十五年覆准：福建省水师提标五营、澎湖水师三营、台湾水师三营分拨兵船，各书本营旗号，每月会哨一次，彼此交旗为验。如由西路去者，提标哨至澎湖交旗、澎湖哨至台湾交旗，皆送台湾镇查验；由东路来者，台湾哨至澎湖交旗、澎湖哨至厦门交旗，皆送督、抚查验。如某月无旗交验，遇有失事，照例题参。
五十六年覆准：福建省台湾、澎湖两协副将，岁率三船亲身出洋，总巡各本管洋面；两协游、守，分巡各本汛洋面。海坛、金门二镇，各分疆界为南北总巡；每岁提标拨出十船，以六船归巡哨南洋总兵官调度、四船归巡哨北洋总兵官调度。其台、澎二协副将、金门、海坛总兵官，均于二月初一日起，九月底止，期满撤回。至各营分巡官兵，挨次更换。如遇失事，各照例题参。
——以上见“钦定大清会典事例”卷六百三十二。
简阅
绿营简阅营伍
绿营简阅营伍
乾隆元年奉旨：‘各省营伍离提、镇辽远，不能亲身稽察；该督、抚酌量地方营制，如何令提、镇等隔数年一次亲身查阅？详议具奏。钦此’。遵旨议定：……福建总督（今改闽浙总督）到任后，阅一次。水师提督（今裁缺），一年阅海坛、闽安、烽火门等处，一年阅金门、南澳、铜山等处，以二年而遍。陆路提督，一年阅兴化、福州、福宁、建宁、延平等处，一年阅泉州、漳州、龙岩、汀州、邵武、永春等处，以二年而遍。海坛、金门、南澳、台湾四镇水师营汛，每年阅一次；福宁、汀州、建宁、漳州四镇陆路营汛，每年阅一次。……各将出巡回任日期及各营汛官兵技艺是否纯熟、军装器械是否齐全？具本题报。
五十一年谕：‘前因台湾孤悬海外、远隔重洋，民情刁悍，奸徒易于滋事，向来亲派御史前往巡视；职分较小，且不能备悉该处情形，实属有名无实。是以降旨将请派巡台御史之例停止，令该督、抚及水师、陆路两提督每年输值一人前渡台湾，严行稽察；如地方文武有骪法营私、扰累兵民之事，即可就近查明，据实参奏。今思福州将军亦系该省大员，自应一体轮派。嗣后着该省将军与督、抚、提、督分年轮值一人前渡台湾，实力稽查整顿，以期永靖海疆。倘有仍前骪法贪黩等情，即行据实参办。至海洋风信靡常，前已降旨令该督、抚等止须俟风信平稳时配渡前往，不必拘定时日。但远渡重洋，究系涉险；如该将军、督、抚、提督内有年逾七十者，着免其前往，以示体恤’。
五十三年谕：‘额设兵丁，原以备差操、防守之用。乃台湾镇将各署内竟设有旗牌、伴当、内丁、管班四项名目，总兵署内至有三百余人之多；以致各设兵丁分班轮值，其余俱在外自谋生理，甚至有挂名在内贴钱包差、代班差操等弊；实属不成事体！不可不严加禁革。恐别省提、镇、将弁各署，亦有似此者。着各省督、抚即行详悉严查，如有仍前设立名自、任意役使兵丁至如许之多者，即将该提、镇、将弁严参治罪；务令额兵一体照常操演，毋许藉端旷伍，致滋他弊。第恐日久因循，不能认真整饬；嗣后该将军等每年轮往查察，务宜实力整顿，秉公办理’。
又谕：‘台湾镇、道各员，令将军、督、抚、提督大员于每年轮往查察，将镇、道、府、厅备弁佐杂各员通行查核具奏。倘有贪纵殃民款迹别经发觉，将未经参劾之员从重治罪’。
——以上见“钦定大清会典事例”卷六百三十八。