丁未，趣总督杨茂勋等速取重庆、夔州。上谕议政王等曰：屡命总督杨茂勋、提督徐治都等溯江速上，直取重庆、夔州。今兵抵何处，进止若何？贼情形若何？初未奏闻。将军赵良栋攻克白水坝、青川，招抚龙安，去成都逼近，恢复非远。将军王进宝亦分兵三路于此月初旬进逼保宁，逆贼王屏藩等困迫，必各溃遁。杨茂勋、徐治都等宜乘机急取重庆、夔州，剿御逆寇。其移檄严饬趣使进兵，如迟延观望、误此事机，严治其罪。
以黄明为援剿总兵官，授叶秉忠总兵官职衔。先是，马承荫标兵饷匮鼓噪，承荫报大将军简亲王喇布即拨饷给发。其后理事官麻勒吉等上言：黄明、叶秉忠在贼中，俱系伪将军；今同来归诚，马承荫授为将军伯，而黄明、叶秉忠未授职衔，致兵众肆行。叶秉忠已年老乞休，无复异志。惟黄明强悍，为柳州官兵所慑服；若不调用他所，终恐为患。上命授黄明为援剿总兵官，率马承荫标兵一千赴将军莽依图军前，随大兵进剿云、贵；叶秉忠授总兵官职衔，许其休致。
庚戌，命马承荫标下设立五营。先是，上命马承荫设立五营，会剿云、贵。至是，大将军简亲王喇布奏：五营兵少，应增援剿二营，共为七营；营各一千人。上谕：凡将军标下，无设七营之例。马承荫所属官兵，黄明率一千随征云、贵外，广西省城甚重，其更拨一千赴大将军简亲王军前。马承荫标下仍立五营，兵五千；参将、守备各官，听其选择具奏。
甲寅，授将军乌丹、王进宝进取机宜。上谕议政王等曰：将军赵良栋等军深入四川，保宁、重庆、夔州诸处，速宜平定。将军乌丹、王进宝等军虽抵保宁，必于蟠龙山相对立营。果尔，恐不能无稽时日。今宜面蟠龙山，分兵坚垒，别遣一军，渡昭化江，壁锦屏山下，满汉兵合势以规取重庆、夔州，则保宁诸处可以即定。其趋总督杨茂勋、提督徐治都等速即进兵，提督王之鼎亦速入蜀，会赵良栋军。
乙卯，将军赵良栋奏复成都。良栋率官兵自龙安剿贼，是月初四日追至旧州明月江，贼断桥守江，良栋遂督兵浮水渡江击贼，令总兵官王进才等分两路直取成都，而亲率大兵继进。初八日，至绵竹，伪劲武将军汪文元迎降。十一日，至成都二十里铺，伪巡抚张文德等率文武伪官二百余人迎降；成都遂复。
丙辰，将军王进宝奏复保宁。十八年十二月，进宝兵既复朝天关、广元县，分三路趋保宁；去城二十里，据孔道而军。是月十三日，贼二万余来犯，进宝分遣官兵大败之；追剿至锦屏山，破贼四垒。贼退宝桥，我兵又击之，夺桥斩关，遂入城。贼渠王屏藩、伪将军陈君极自经死，生擒伪将军吴之茂等三人、伪总兵郭天春等十七人，保宁遂复。
丁巳，命湖广、广西诸将分路进剿。上谕议政王等曰：览将军乌丹、王进宝等奏，我兵大败逆贼，恢复保宁；伪将军王屏藩缢死，吴之茂、张起龙就擒。将军赵良栋前奏大败逆贼、恢复成都，今正当贼众动摇之际，王进宝、赵良栋宜同心协力，惟期有济大事；剿抚余贼、绥辑地方，商酌而行。作何区画？仍令奏闻。王屏藩等俱系贼帅，王屏藩首级并吴之茂、张起龙悉解来京。诸路将军等宜乘此时分路速进。其移檄湖广、广西诸处大将军、将军、总督、提督等，咸使知之。
己未，命勇略将军赵良栋为云贵总督，仍兼将军。上谕议政王等曰：云、贵边疆重地，苗民杂处；总督职任要重，必得才略拔群者，方克胜任。将军赵良栋勇略茂着，操守廉洁，虽系武职，精通文义。若任为总督，必能平定疆域，抚绥军民，其改授云贵总督，仍兼将军。
二月辛酉朔，谕湖广、四川诸将进取机宜。上谕议政王等曰：今成都、保宁皆已恢复，乘此事机，即宜速定云、贵。四川既平，湖南已属内地；顺承郡王贝子准达、都统范达礼等，尽率所部之兵溯江而上，规取重庆。顺承郡王等即于重庆驻守，将军乌丹、鄂克济哈与赵良栋等同进取云、贵。乌丹、鄂克济哈于顺承郡王军中简精兵有马者，将之前行。总督杨茂勋、提督王之鼎驻守成都，将军王进宝驻守四川，徐治都还军守彝陵及荆州诸处。
命都统王国栋等剿御海寇。巡抚金俊奏：海贼谢昌孝、李积凤等不时乘潮往来，侵掠沿海之地；请调平南王藩下都统王国栋等前往剿御之。上谕：都统王国栋等身在省会，不宜纵贼披猖。王国栋与副都统尚之璋、总兵官宁天祚等，其率藩下舟师速图剿御。贼退之后更有侵犯内地者，王国栋等与巡抚金俊会商扑灭。
祖泽清父子伏诛。泽清世受国恩，历官至高州总兵官，据城以叛；及王师讨之，势蹙乞降。上贳其罪，授銮仪卫銮仪使。泽清不思宣力赎罪，复行叛逆；为官军所执，械送京师。上命磔泽清并其子良楩于市，诸子家口籍没入官。
命总督杨茂勋等招徕四川流民。户部上言：四川久为贼据，苛虐横征，小民相率流亡。请敕督、抚急行招徕抚绥，以副皇上爱民至意。上命杨茂勋、杭爱速赴任督理军饟，并招徕流民，俾安生业，毋误农时。
乙丑，命都督同知高孟等为四川各路总兵官。上谕兵部：四川关系重要，新经恢复，宜简任素有谋勇之人。高孟、王用予、王潮海、王进才，才略优长，边疆着绩。高孟仍以都督同知，授为镇守四川川北等处总兵官；王用予仍以都督同知，授为镇守四川松潘等处总兵官；王潮海以副将，授为镇守四川重庆等处总兵官；王进才以参将，授为镇守四川建昌等处总兵官。
丙寅，将军王进宝等奏官兵复顺庆。进宝与将军乌丹等既克保宁，遂遣镇守西安将军佛尼勒、总兵官王潮海等率兵取顺庆；我兵前进，沿途招抚盐亭、潼川、中江、南部诸州县，悉下之。正月十八日抵顺庆，伪知府彭天寿等率众迎降。于是，蓬州、广安州、合州、西充、岳池、营山、渠县、邻水、仪陇、遂宁、蓬溪诸州县相继悉定。
丁卯，命郎中苏赫臣等运饷给大将军顺承郡王勒尔锦军。上谕议政王等曰：今四川已定，杨茂勋等所乘之船俱无所用；运饟事关重要，郎中苏赫臣、员外郎噶尔萨其亲督粮务，即以此船载楚饷溯江运致顺承郡王军，勿令断绝，有误军需。
命将军莽依图等帅师进取云、贵。上谕议政王等曰：成都、保宁、顺庆诸府今已恢复，四川底定。湖广大兵，今正分道进定云、贵；其广西满洲绿旗大兵休息日久，亦当乘机速进。大将军简亲王留每佐领兵一人于桂林，其余官兵，王尽帅之往屯柳州。大将军平南亲王可驻守贵县，将军莽依图、马承荫、都统马九玉、总督金光祖等可各率所部官兵并酌调平南亲王藩下官兵分道进取云、贵。