总督祈祷疏文
福建总督姚启圣谨抒愚衷、上请天妃主裁而言曰：四海广阔，惟神是凭；风涛顺逆，亦惟神是主。是神之权大、德尊，适足侔天地而并日月也。今者，荷神有灵助，除六十年猖狂之大寇，竟停五、六月台飓之大风，除生灵之大害，立朝廷之殊功。启圣得以安享太平，皆尊神之默佑也。今启圣亲总舟师，遴福宁州总兵黄大来、参政道刘仔捧颁恩敕前至台湾，因尚少西北正风，是以越庙求神，冀借一帆，早到台地。启圣百叩稽首之下，见庙貌尚有未妥，寸心甚为不安；况正殿朝南，而朝天楼、山门各俱西向、亦非宜於神灵之所凭依也。今启圣议以正殿既朝南，则朝天楼、钟鼓楼、山门俱宜开辟朝南。此为一议。如神意定於朝西，则门山、钟鼓楼止须盖完，惟将朝天楼升高改为正殿，而以原庙为神寝宫。此又为一议。若神意不准二议，原欲仍旧向，启圣亦惟神是听，不敢有违。启圣既经目击，不敢吝惜，敬陈三议，分列三辟，惟神裁定！
托梦护舟
随征同知林昇同总兵官游澎奉委往抚台湾，於康熙二十二年九月初五日由湄洲放洋，初六晚至台湾。十五日自彼开驾，而十八夜梦天妃在船；有四人戴红帽从水仙门而上，问其所来，答曰：舟船有厄，将为尔护。十九早，舟过柑桔屿，舟次搁浅，舵折四尺，将溺，众惊惧，投拜神前，恳求庇佑。倏见天妃现身降灵保护，乃得平稳。十九晚收进八罩，报复成功。总督慰甚。同知林昇到家虔诚答谢。
涌泉给师
靖海将军侯施於康熙二十一年十月奉命征剿，大师云屯於平海。此地斥卤，樵汲维艰。只有神宫前小井一口，甚浅，当炎天旱候，尤为枯竭；数万军取给炊爨，弗继。将军侯乃祝诸神，以大师札住，愿藉神力，俾源源可足军需。祷毕，而泉水涌溢，真不异耿恭拜井之奇。因是千万军取用不竭。爰额之曰师泉井，作师泉志以着神庥。
师泉井记
今上御极之二十一载壬戌孟冬，予以奉命统率舟师，徂征台湾。貔虎之校，犀甲之士，简阅而从者三万有余。众驻集平海之澳，俟长风，破巨浪，以靖扫鲛窟。爰际天时阳亢，泉流殚竭，军中取汲之道，遥遥难致。而平澳迁徙之壤，介在海陬，昔之井廛，尽成堙废。始得一井於天妃行宫之前，距海不盈数十武，渍卤浸润，厥味咸苦。其始未达深源，其流亦复易罄。询诸土人，咸称是井曩仅可供百家之需，至隆冬泽愆水涸，用益不赡。允若兹，则三军之士所藉以朝饔夕餐者果奚恃欤？
予乃殚摅诚愫，祈吁神聪。拜祷之余，不崇朝而泉流斯溢，味转甘和。绠汲挹取之声，昼夜靡间，歕涌滋溉，略不显其亏盈之迹。凡三万之众，咸资饮沃，而无呼癸之虑焉。自非灵光幽赞，佐佑戎师，歼殄妖氛，翼卫王室，未有弘阐嘉祥，湛泽汪濊，若斯之渥者也。因镌石纪异，名曰师泉，昭神贶也。
在易，地中有水曰师。师之行於天下，犹水之行於地中；既着容民畜众之义，必协行险而顺之和。是知师以众正，乃克副大君讨贰抚顺、怀柔万邦之命。而扬旌海外，发轫涯涘，神异初彰，闓惠覃布，诞惟圣天子赫濯之威，以致百灵效顺，山海徵奇，亶其然乎！
昔贰师剑刺大宛之山，而流水溢出；耿恭拜祷勒之井，而清泉奔涌；并能拯军士於渴乏，着万里之奇功。乃今井养不穷，三军获福，予之不敏，曷以答兹鸿嘉之赐哉！是用勒之贞珉，以志不朽云。
灯光引护舟人
将军侯施於康熙二十一年十月舟次平海。因谋进取，於十二月二十六夜开船。一宵一日，仅到乌坵洋，因无风不得行，令驾回平海。未到澳而大风倏起，浪涌滔天，战舰上下，随涛浮漾外洋，天水淼茫，十无一存之势。次早风定，差船寻觅。及到湄州澳中，见人船无恙。且喜且骇曰：似此风波，安得两全？答曰：昨夜波浪中，我意为鱼腹中物矣！不意昏暗之中，恍见船头有灯笼，火光晶晶，似人挽厥缆而径流至此。众曰：此皆天妃默佑！即棹回报上。将军侯因於康熙二十二年正月初四早，率各镇营将领赴湄致谢，遍观庙宇，捐金调各匠估价买料，重兴梳妆楼、朝天阁，以显灵惠。
澎湖神助得捷
康熙二十二年六月内，将军侯奉命征剿台湾。澎湖系台湾中道之冲，萑苻窃踞，出没要津，难以径渡。侯於是整奋大师，严饬号令。士卒舟中，咸谓恍见神妃如在左右，遂皆贾勇前进。敌大发火炮，我舟中亦发大炮，喊声震天，烟雾迷海。战舰衔尾而进，左冲右突，凛凛神威震慑，一战而杀伤彼众，并淹没者不计其数。其头目尚踞别屿，我舟放炮攻击，遂伏小舟而遁。澎湖自是肃清。
先是，未克澎湖之时，署左营千总刘春梦天妃告之曰：二十一日必得澎湖，七月可得台湾。果於二十二日澎湖克捷，其应如响。又是日方进战之顷，平海乡人入天妃宫，咸见天妃衣袍透湿，其左右二神将两手起泡，观者如市。及报是日澎湖得捷，方知此时即神灵阴中默助之功。将军侯因大感神力默相，奏请敕封，并议加封。奉旨：神妃已经敕封，即差礼部郎中雅虎等賫御香、御帛到湄，诣庙致祭。时将军侯到湄陪祭，见佛殿僧房尚未克竣，随即捐金二百两凑起。
琉球阴护册使
康熙二十二年，钦差册封琉球，赐蟒玉正一品汪、林等官时在福省，於六月二十日谕祭天妃於怡山院。是时东风正猛，不意行礼甫毕，旗帜忽皆北向，遂解缆而行。所有应历水程，悉若飞渡而下，才二昼夜即到马齿山，遽至那霸港，直达迎恩亭前。琉球之人皆谓从来封驾未有若此飞渡而来。迄夫典礼告竣，开驾而回，狂涛震撼，巨浪滔天。舟中人皆颠覆，烟灶等物尽委逝波，茫无彼岸，诚万难获全。天使官肃将简命，共吁神妃求佑：返节无恙，当为奏请春秋祀典，永荷神庥！虔祷方终，神应如响。黑夜中漂泊，众见舟竿上有二灯笼光焰在前。时束桅铁箍巳断十三，桅应散而尚全；系篷之顶绳断不可续，篷宜堕而犹悬：桅拴裂逾尺，桅应倒而仍柱。船不及坏，因急驶往归闽海港。中使复奏请春秋（以下残阙十余字）。
第一章求佳儿大士赐丸
天后，林氏女也。先世自唐迄宋，代有功绩，世勳承袭，遂家於莆田。父惟悫公尤好善乐施，敬奉大士，年四旬余，止一子，焚香祝天，愿得佳儿。己未六月，夜梦大士告曰：上帝式佑尔善；授以丸药，遂孕。
第二章闻异香我后降世
宋太祖建隆元年庚申三月二十三日，方夕，红光射室，异香氤氲，乃诞天后，为惟悫公第六女也。
第三章遇道人秘传玄诀
后生而聪颖。八岁悉解文义，十岁即好佛经。十三岁，遇老道士曰：若具佛性，应得度入正果；授以玄微秘法。
第四章窥古井喜得灵符
后年十六，时与诸女游，窥古井，忽见神人捧铜符一双，上有仙官拥护；群女骇奔，后受之不疑。自此法力玄通，屡显神异。
第五章运神机停梭救父
时值九秋，后父、兄两舟济海，西风正急，波涛震奔。后方织，忽心动，遂闭睫神驰，手持梭，足踏机轴，若有所挟而恐失之之意。
第六章闻疾呼失柁哭兄
机上凝神，毋怪急乎。后醒而泣曰：父得保全，兄已没矣！始知顷所足踏者父之舟，手持者兄之舵。呼醒舵摧，竟不获救。
第七章资民食泻油生菜
湄有小屿，在旁流中。后游其地，适母遗以菜子油，后即倾地；皆抽菜甲，灿然青黄，布满山塍。至今四时不绝，遂名为菜子屿。
第八章渡沧海指席为帆
一日，后欲渡海，舟楫不整，舟人难之。后指草席曰：无妨，即此可凭矣。悬之竿，若凫鸥之出没，追狂飙而鼓棹，破巨浪而旋槎。观者惊为飞渡。
第九章救舟人小草成杉
屿西有山曰夹山，礁石林立，船不敢近。一日，风涛震撼，舟人哀号，人莫能救。后掷草数根，化成大杉排空，舟得以附焉。
第十章解旱灾甘霖沛野
后年二十一，莆田大旱，父老咸称非神姑莫解。尹诣请，许之，拟壬午申刻当雨。至期，大沛甘霖，遂获有秋。人皆欢呼颂德。
第十一章策铁马代楫渡江
一日，渡江无楫，遂策檐前铁马，快若奔腾，人骇为青骢。行水上天，马骤空中，只不见其解鞍嘶秣耳。
第十二章收神将演咒施法
后年二十三，收顺风耳、千里眼为将。先是二神为祟西北，民间苦之，求治於后。后曰：此金水之精，乘旺所锺，我当以火土克之。乃演咒施法，二神遂惧而皈依焉。今俱封为将军。
第十三章率水族龙子来朝
东海多神怪，后乃命枻中流，风日澄霁，中见水族骈集，龙子鞠恭於前。後敕免朝，即退。至今天后诞辰，犹然庆贺；是日渔者不敢施罟下网。
第十四章投法绳晏公归部
有晏公者，浮海为怪。后先施法力制之；虽仗神威，未能诚服。後又逞色变龙，兴涛滚浪，来犯后舟。后投下〈律，糸代彳〉绳，随摄随粘，牢固难解，始惧而伏罪，后嘱曰：东溟险阻，尔当护民。收为部下总管。
第十五章莆田尹求符救疫
岁祲疫，莆田县尹阖家病笃，吏告以请救，尹乃斋戒诣求。后曰：此天灾，何敢妄乾；念其仁慈素着，代为忏悔。取菖蒲九节，书符贴，并煎饮之，立瘥。自此名彻寰中矣。
第十六章高里鬼现相投诚
高里乡突有阴怪为祟。人咸求治於后。符咒贴处如鸟飞遁。後迹其穴，扫除，见一团黑气中惟鹪鹩小鸟踏空而坠，化为枯发；焚之，即现本相，乃一小鬼也，叩拜投服焉。
第十七章逐双龙春夏雨止
后年二十六岁，自春至夏，霪雨不止。省官奉天子命，所在祈祷。莆人诣请於后，后允为邑造福。后见白虯奔跃，二龙游荡，乃画灵符锁住白虯，遽有金甲神人逐二龙遁。莆即大霁，秋且告稔。奉旨致币报功。
第十八章驱二孛南北津通
吉蓼城西有桥跨海，南北通津。忽一日，怪风扫地，桥柱尽折，行人病涉焉。后知二孛为祟，遥见黑气冲霄，即演灵术驱之。人渡如故。
第十九章破魔道二嘉伏地
时有二魔：一曰嘉应，一曰嘉佑。或於荒坵中，或於巨浪中为害。或於客舟中流现赤面金装，当前鼓跃。后化宝舟，出没波涛间，嘉佑舍客舟而就后船。后以咒压之，遂惧伏。嘉应从山路犯后，后拂尘霾，任其腾跃，终不越故处，遂悚惧而遁。然魔心未净，後岁复作，乃得归正。
第二十章证仙班九日昇天
宋太宗雍熙四年丁亥重九日，同诸姊登高。於湄峰山巅，恍闻空中丝管韵叶，八音齐奏，仰见銮舆翠盖，仪皂幢旛，杂踏而至。後乃跨云而上，众咸欷歔惊异。俄而彩云布合，不复见矣。嗣后屡呈灵异。相率立祠，号曰通贤灵女。
第二十一章示地利创始建庙
宋高宗绍兴二十六年丙子，以郊典特封灵惠夫人。次年秋，神来相宅，取莆城东之水示民曰；白湖梦示章、邰二族。丞相陈后卿闻之，验地果吉，兴工创建庙宇。
第二十二章驱水怪咸愿捐金
商人三宝货船忽椗胶不起。舟人入水，见一怪坐椗。各惊惶，诣祠祈祷。恍见神后飘渺前来，怪即遁，椗立起。三宝许愿捐金，改观庙貌。
第二十三章凭枯楂圣墩立庙
宋哲宗元佑元年丙寅，莆东有墩常现光，迹之，一枯楂也。渔人拾之归，楂自还故处。再试亦然。乡人获梦，知楂为神所凭。制干支公闻之，募建庙，号为圣墩。
第二十四章得铜炉锦屏建祠
哲宗元符初，莆之南有地曰枫亭，其溪通津达海。戊寅潮长时，漂一铜炉，宝光陆离。枫人收之，同梦后嘱。爰备香花，奉至锦屏山下建祠以祀。
第二十五章护粮船额颁灵惠
元文宗至顺元年庚午春，粮船开洋遇风，桅樯漂荡，战栗哀号。忽祥云霭霭，见空中朱衣拥盖，灯火垂光。既而风息，得获全安。奉旨赐额曰灵惠。
第二十六章疗民疫井号圣泉
宋孝宗乾道二年春，大疫。神降於民李本家言曰：白湖旁，可凿泉得饮，以除疫病。果然，泉味清冽，饮如甘露，朝吸而夕瘥焉。人感回生之功，甃为井。号曰圣泉。
第二十七章答神庥千秋崇祀
海邦履险，临於不测之机；神灵呵护，应於非常之际。或化蝴蝶、蜻蜓，绕桅樯而垂引；或令瑞禽、燕雀，示舟楫以无虞。至於明灯璀璨，慈悲灵济於若隐若现之间，瑞气氤氲，显赫神通乎可望可即之下，总在一诚可格，未可思议名言者也。