方荫桓既归、鸿章未发、朝命三品以上大员议和战；迨割地议起，朝野忧愤，台湾臣民争尤力。未几，鸿章成约归，割地、赔款、商利均从倭意；方称疾翱翔天津；于是京朝官之封章、疆臣之电奏凡百十上，会试公车在都者亦腾章力阻。朝意颇为动，令鸿章改议；鸿章不从（三月二十八日，鸿章电总署略称：‘来电敬悉。台多乱民，傥官为唆怂，徒滋口舌，贻累国家。俄、法、德各向日本理论，不允新约；想该驻使第已告知。何日覆信，乞察示！倭催批准互换，或虑及此。倭甚倔强，非三国动兵，恐不肯听；若互换愆期，则责言及我，兵争又至，望慎筹之’云。二十九日，又电总署云：‘赔款一事，鸿实已舌敝唇焦，磨到尽头处；伊藤两次函催，系“哀的美敦书”，谓‘无可商、无可改’。鸿未敢擅允，迭经请旨定夺；旋奉十九、二十日两次电旨，饬即与之订约。
若尔时早令分十五年归还，展宽年限、免入息银；亦必与伊等面议。如不允，即决裂西归，亦不辱命。今既遵旨定约，复令原使臣改议电商，彼必不允；和约既成，不可悔。应请简派重臣，候换约时与商，或有济。鸿病莫能兴，断难往烟台；且不可以一口说两样话，徒为外人訾笑。请代奏’云），而军机大臣孙毓汶、徐用仪实主之。时中日和局，美国居介绍，英人依违其间，实阴袒倭；而俄、法、德三国恶倭人之攘我土地，法惎其索台湾，俄怒其据辽东，而俄阻尤力。四月朔，三国驻俄公使公阻其据辽东，叠以公文致日本外务府；而俄舰队东来甚伙，分泊日本长崎及我辽海。日本畏之，初十日许以辽东归我。三国公使遂照会我总署：‘辽东地不毕归，毋批准换约’。会我中外诸臣亦连章阻款议，朝廷意犹豫。乃鸿章遣伍廷芳迎驻津倭领事于大沽，密令其速电东京促我换约；而毓汶等亦以属驻我新倭使林董于京师，于是求御宝换约益急。上乃命王文韶、刘坤一议决和战；文韶等奏颇依违，且告海啸成灾（文韶奏略称：‘钦奉初一日电旨，以和，战两事饬臣与刘坤一各抒所见，据实直陈等因，钦此。臣惟旨意，以不和即战。计及沈阳、京师两地重大所关，务筹万全。臣在津言津，如提督聂士成、总兵吴宏洛、章高元、陈凤楼等军声气联络，必可一战；其榆关以迄辽、沈各路军营是否可靠，臣实不敢臆断。见在军事可胜、不可败，势成孤注，与未经议约以前不同。事关全局安危，应请饬下军机大臣、督办军务处、总理衙门通盘筹议，请旨定夺。
臣与刘坤一昨至唐山晤商一切，意见大略相同；合并声明。再，初四日大风雨，天津南北路线俱断；谨另摺由驿六百里驰陈’云），和议遂决。乃以道员伍廷芳、联芳为换约使，赴烟台。十四日，倭换约使伊东美久治乘其兵舰“八重山”抵烟；语及更易割辽条约，谓未奉其国命，马关约不可改；持不下。时俄舰泊烟台港内者凡十舰，皆整衣理械、卸舱面碍战诸物，若即开战状；美久治大恐，鸿章等亦惶惧。旋得倭电从归辽议，夜午竟换约。是役也，倭人已允展换约期七日；而鸿章转促之。盖我使臣王之春（赴俄祭吊并贺新君即位专使）自俄归，道出法京巴黎，法方自憾其阻台湾之割而不得也，之春乘机说之，以台湾质诸法；法已许价□万万佛郎，其土地财货归法，而海关仍归我，凡质□□年任我赎还（是议我南洋实主之）。议垂成，法人谓其猝不及接收，已自电其驻倭公使，为我请诸倭展议约限七日，倭人亦允之。而我驻使龚照瑗侦知之，惎之春之独有其功也，遂急电鸿章；鸿章怙其弃台湾之成议也，遽报毓汶、且急电伊藤博文，故烟台换约亟以夜成，法议遂解。闻者惜之。
款局既定，给美员福世德薪劳十五万员。二十五日，派鸿章之子经方为割台湾使，辅以福世德；倭亦以其酋桦山资纪为台湾总督，经方乃即倭舶中交割。
于时倭队尚据辽东，俄、法、德三国诘之；倭乃索我赎费库平银一万万两，徐减及五千万两。八月下旬，三国公断以三千万两赎辽东，倭人听之；而要以赎价毕偿后三月兵乃撤。朝廷乃复派鸿章与倭使林董议还辽约，林董要我四款（一、中偿日银三千万两。二、俄、法、德永不得占东三省；华亦不割让。三、许日在大连湾任便通商。四、大东沟及大孤山俱开商埠）；不果议。九月四日，三国复责倭速撤辽东兵，还辽议乃定。二十二日，互换还辽约于京师；凡七款：